一边读书一遍批注的主要好处是有助于加深理解、方便二次精读、方便以后查找翻阅。
做读书批注或者标记的基本方法是：阅读的时候在书中划出要点、写上想法或感悟。通常有三个步骤：
首先是确定读书目标。在读书前，要想清楚我为什么要读这本书，目标是什么，比如解答某个疑惑、找到某种方法等。带着目标读书，我们才能知道自己要在哪里画线和做记号。
其次是确定属于自己的一套记号。也就是给不同颜色的笔、标签、符号，确定一个固定的意义。比如用绿色表示与自己工作相关的重要内容、用红色表示新知识新观点、用蓝色表示好词好句等，人名用圆圈、地名用方框等。对于自己产生的想法和感悟，可以写在书页是的相应位置，也可以写在便签上（不同颜色的便签也要有固定的意义），然后贴到相应的位置。这样形成习惯后，我们在看书、做笔记、查找信息的时候就能快速且清晰的找到自己需要的内容。
其三是做索引。就是在书的扉页或空白处把你做的各种记号写下来，然后在对应的记号后写下对应重要知识的页码。有了索引，以后一旦需要用到书里的相关内容，我们就能快速的找到它。
在读书的过程中，做记号做批注只是其中的一个小环节，关键是掌握恰当的阅读方法。
首先要带着问题和目标去读书。读书之后没太多印象的原因就是因为读书时很盲目，脑子里没有带什么问题，没有明确的目的。读书得用心，用心得“注意”，读书时围绕着一个问题、目标，与此有关系的就注意，你注意哪一项，哪一项便会自然地跳跃出来，映入你的眼帘，钻进你的脑子里。如果书籍较好，准备反复阅读的时候，需要注意的是每次阅读都要单独寻找一个目标。这样你看到的内容才会不一样。
其次要懂得快速阅读。对于大部分书籍，重要的内容只占全书的两成左右，所以要改变逐字逐句、一板一眼的阅读习惯和方法，要学会用快速阅读的方法阅读。我在学习了“精英特速读”之后，通常是以一分钟两千字左右的速度进行阅读，读的过程中找到感兴趣的地方、对我重要的地方、看不懂的地方，然后再放慢一点速度来阅读，对于阅读中发现的精华内容，再进行一遍精读。
读完之后要做一点笔记。较为基本的一点是：在读完一本书之后主动地去引导自己回忆和思考，比如问问自己：这本书的主要内容是什么？这堂课主要讲了几个重要知识点？通过这本书我学到了什么？书中有哪些知识是我过去从来没有听说过的？这本书对我的帮助是什么？这个理论或方法可以用来解决什么问题，具体要怎么做等等。为了更好地理解和记忆书中的内容，可以学着结合书籍目录，根据自己实际理解情况对内容进行拆分、重组、整合、延伸，做做读书笔记。