臭氧灭菌灯和紫外线消毒的区别是：
紫外线与臭氧消毒均对供应室无菌区有明显消毒作用，数据又显示臭氧消毒前后的菌落减少数明显高于紫外线，即臭氧对细菌的杀灭率更高，此点提示在临床工作的无菌区，要想达到更好的消毒效果，臭氧消毒器为首选。
临床中消毒以紫外线消毒为主，但紫外线灯管发出的低能量电磁辐射穿透性能差、容易受尘埃及物体的遮挡，影响对空气消毒的质量，同时紫外线消毒方式对紫外线照射的距离、消毒的环境、照射时间以及照射对象均有较高的要求，加上其操作过程中易受人为因素的影响，消毒效果常常很不稳定。
在临床中又发现紫外线对人体有损害，可使局部皮肤产生红斑，眼睛长时间直视可引起紫外线眼炎，长期接触紫外线还可引起白细胞下降等相关疾病。而臭氧消毒器是运用放电法，以空气为原料，运用先进的控制系统制备一定量的臭氧,在相对密封的环境下，呈现弥漫性循环气体，且扩散均匀，通透性好，克服了紫外线消毒留有死角的问题，能达到全方位、快速、高效的杀菌目的，同时臭氧的杀菌谱广，既可以杀灭细菌繁殖体、病毒、芽孢、真菌和原虫孢体等多种微生物，同时又具有较强的除霉、除臭的功能。
臭氧杀菌：
臭氧以氧原子的氧化作用破坏微生物膜的结构，以实现杀菌作用。臭氧对细菌的灭活反应总是进行的很迅速，与其它杀菌剂不同的是：臭氧能与细菌细胞壁脂类的双键反应，穿入菌体内部，作用于蛋白和脂多糖，改变细胞的通透性，从而导致细菌死亡。臭氧还作用于细胞内的核物质，如核酸中的嘌呤和嘧啶破坏DNA。臭氧首先作用于细胞膜，使膜构成成份受损伤，而导致新陈代谢障碍，臭氧继续渗透穿透膜，而破坏膜内脂蛋白和脂多糖，改变细胞的通透性，导致细胞溶解、死亡。
紫外线消毒：
紫外线杀菌消毒是利用适当波长的紫外线能够破坏微生物机体细胞中的DNA（脱氧核糖核酸）或RNA（核糖核酸）的分子结构，造成生长性细胞死亡和（或）再生性细胞死亡，达到杀菌消毒的效果。紫外线消毒技术是基于现代防疫学、医学和光动力学的基础上，利用特殊设计的高效率、高强度和长寿命的UVC波段紫外光照射流水，将水中各种细菌、病毒、寄生虫、水藻以及其他病原体直接杀死。