1.收集证据。收集证据在初核阶段和立案审查调查阶段进行。在初核阶段收集证据，要以收集客观性证据为主，采取的调查措施主要以不限制人身权利、财产权利的措施为主，如询问、谈话、查询、调取、勘查、鉴定、技术调查、限制出境等。在立案审查调查阶段，应当全面收集证据，所有的调查措施按规定批准后都可以使用。收集证据要注意三点：一是收集的主体要合法。调查人员两名以上，携带工作证件。二是收集的程序要合法。出具相应的法律文书，需要见证人的要有见证人在场并在文书材料上签字，要求录音录像的必须同步录音录像。三是收集的证据形式要合法。勘查的要形成勘查笔录，委托鉴定的要得出鉴定意见，物证、书证原则上是原物原件，言词证据都要形成笔录并阅看后签字摁手印等等。
2.审查证据。收集到证据后就要对收集到的证据进行审查判断，筛选出具有证明力的证据，形成证据链。审查证据依据的规则有：意见证据规则、最佳证据规则、补强证据规则、关联性证据规则等。例如查询到一个人的银行流水几百页，但是与犯罪有关联的记录就几条，能与其他证据结合，得出赃款的流向，因此就这几条记录具有证明力。再比如，询问笔录中总会有证人的猜测、判断、推定等主观表述，根据意见证据规则，应当予以排除，除非能根据经验判断符合事实。
3.综合分析得出结论。将收集到的证据经过审查，排除其中无关的证据，将最终的证据按事分类，每一类证据证明一部分犯罪事实，如一些证据证明了犯罪的目的和动机，是为了从事违法活动还是营利；一些证据证明了犯罪的行为方式，贪污具体的手段是骗取还是窃取；银行的流水和单位的会计项目证明的涉案款物的流向等等。
纪检部门纪检部全称纪律检查部。是专门负责一个组织的纪律的部门。解放军总政治部和大军区级政治部也都设立纪检部，负责解放军或本系统的纪律检查工作。一般学校也会设此部门。负责管理学校学生党员的发展过程中出现的一系列问题。国家纪检部是国家纪律检查部门。会查男女关系问题的！对于成家立业的,在外搞男女关系,对单位造成影响,扰乱了社会秩序,纪委会严肃处理。现在随着人民主人翁意识、法治意识的增强，越来越多的人学会行使监督权，对党政机关及公职人员的投诉举报也呈爆炸式增长，估计大家都有投诉举报的经历，即使没有举报过公职人员违纪违法，起码12345的电话是牢记心中了。当然，有些投诉是作为信访件或投诉件处理，一般由主管部门就解决反馈了，本文主要说纪检监察部门对举报件的处理。每一类证据证明的事实加起来形成全部犯罪事实。需要注意的是，证据得出的结论必须唯一，不存在其他合理怀疑，如果无法排除合理怀疑，还应当继续收集证据，否则可能构成疑罪。
法律依据：
《《中华人民共和国公务员法》》第五十九条
公务员应当遵纪守法，不得有下列行为：
（一）散布有损宪法权威、中国共产党和国家声誉的言论，组织或者参加旨在反对宪法、中国共产党领导和国家的集会、游行、示威等活动；
（二）组织或者参加非法组织，组织或者参加罢工；
（三）挑拨、破坏民族关系，参加民族分裂活动或者组织、利用宗教活动破坏民族团结和社会稳定；
（四）不担当，不作为，玩忽职守，贻误工作；
（五）拒绝执行上级依法作出的决定和命令；
（六）对批评、申诉、控告、检举进行压制或者打击报复；
（七）弄虚作假，误导、欺骗领导和公众；
（八）贪污贿赂，利用职务之便为自己或者他人谋取私利；
（九）违反财经纪律，浪费国家资财；
（十）滥用职权，侵害公民、法人或者其他组织的合法权益；
（十一）泄露国家秘密或者工作秘密；
（十二）在对外交往中损害国家荣誉和利益；
（十三）参与或者支持色情、吸毒、赌博、迷信等活动；
（十四）违反职业道德、社会公德和家庭美德；
（十五）违反有关规定参与禁止的网络传播行为或者网络活动；
（十六）违反有关规定从事或者参与营利性活动，在企业或者其他营利性组织中兼任职务；
（十七）旷工或者因公外出、请假期满无正当理由逾期不归；
（十八）违纪违法的其他行为。
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