蘑菇木材上寄生着多种细菌,如木霉菌、裂褶菌、桦木褐孔菌、鳞翅目等。虫害方面,蛞蝓、蜗牛、辣根对鲜蘑菇有害,天牛幼虫、小蠹虫、白蚁对蘑菇木材有害。加强对香菇场菇木的科学管理,营造有利于香菇生长,但不利于杂菌和病虫害发生的环境。一旦发生了,及时把它放出来。蘑菇木上的菌类可用小刀刮去或涂上2%的石灰水。蜗牛、蛞蝓和其他害虫可以在早上或晚上人工杀死。对于白蚁,可以使用60%的三氧化二砷和40%的滑石粉;或将46%亚砷酸、15%水杨酸和5%氧化铁的混合物喷洒在蚁道和蚁巢上。
常见的杂菌有木霉菌、青霉、毛霉、根霉、曲霉、链霉菌。常见的害虫有鼻涕虫、跳虫、白蚁等。首先,将培养物进行堆肥发酵,利用各种高温微生物产生的生物热杀灭害虫和低温真菌,减少污染源。
快速装袋灭菌。所制备的培养物呈酸性,适合各种微生物的生长繁殖。因此,应尽量在5小时内完成,灭菌时应在4-6小时内将温度升至100℃。培养室冷却通风可减少杂菌污染,提高接种成品率。为防止木霉菌的污染,接种袋可在16℃培养,香菇菌丝可生长,但木霉菌孢子不易萌发,菌丝生长缓慢(木霉菌生长的适宜温度为25~30℃)。香菇菌丝在培养物表面生长到一定程度后,温度逐渐升高,25℃培养至满袋。如果25℃初培养有利于木霉菌丝的生长,杂菌污染率高。
对于局部污染袋,可注入20%甲醛溶液或5%碳酸,以控制污染点扩散。鼻涕虫和白蚁的防治可参照端木栽培的防治方法进行。1%敌敌畏与少量蜂蜜混合,或喷0.1%鱼藤酮或150-200倍除虫菊溶液。