五大连池市的历史可以追溯到遥远的新石器时代，考古发现的遗址揭示了4000年前这片土地上就有人类活动的痕迹。早期的商周时期，这里属于肃族和岁貊的领地，随后经历了秦汉的汉岁地或乌桓地，三国时期归属北夫余地。隋唐时期，五大连池是黑水沫蝎部的居住地。辽代，它成为东京道室韦王府的辖地，乌延突厥也在此居住。金代时期，这片土地隶属于上京路和蒲与路，女真完颜部在此繁衍生息。元代初期，它属于辽阳行省开元路，后来归属水达达路蒲与路万户府，是斡赤斤分封的区域。明朝时，属于奴儿干部司纳木河卫兀的河所管辖，清代则属于布特哈总管衙门，德都成为布特哈八旗正白旗部落的所在地。
1910年，德都成为了讷河直隶的一部分。1915年至1928年，德都隶属于克山县第三区。1929年，设立了德都设治局，并在1933年升格为县。在抗日战争期间，德都先后受伪黑龙江省和伪北安省管辖。1945年8月，德都获得解放，归属黑龙江省，同年11月建立了德都县民主政府。1956年，德都改由松花江专区管辖，1958年并入北安县，成立了青山公社，归属嫩江专员公署。1963年，德都恢复为县，隶属于黑龙江省黑河地区行政公署。1996年，德都县与原五大连池市合并，形成了现在的五大连池市，隶属于黑河市。2000年，五大连池市与风景区进行了分制，原五大连池市改设为风景区管委会，而原德都县则继续发展为今天的五大连池市。
五大连池就是第四纪火山活动给人类留下的一片珍贵遗产，这里山秀、水幽、泉奇、石怪、洞异，是集生态旅游、休闲度假、保健康疗、科学考察为一体的高含量、多功能、综合型国际旅游胜地，不仅在生态科学和地理物理发展史方面对人类有着重大意义，而且在自然美学和环境医学方面更具有独特的观赏和适用价值。