1、适用范围不同
独立样本t检验的数据来源是独立的样本，如同一个班级中男生和女生的成绩是否有差异；而配对样本t检验的范围是同一组对象，例如一个班级中的女生第一次月考和第二次月考的成绩是否有差异。
2、数据性质不同
独立样本t检验中的各实验处理组之间毫无相关存在，即为独立样本，该检验用于检验两组非相关样本被试所获得的数据的差异性；而配对样本t检验的数据是检验匹配而成的，用于检验匹配而成的两组被试获得的数据或同组被试在不同条件下所获得的数据的差异性，组成的样本即为相关样本。
3、t检验统计量计算公式不同
独立样本t检验统计量为：
其中S1^2和 S2^2为两样本方差；n1 和n2 为两样本容量。
而配对样本t检验的统计量为：
其中，Sd为配对样本差值之标准偏差，n为配对样本数。
参考资料来源：百度百科-T检验
t检验与配对t检验有什么不同？
独立样本t检验是进行比较两组数据的差异。配对t检验进行比较两组配对数据的差异。
（1）独立样本t检验
是进行比较两组数据的差异。
SPSSAU分析背景：研究不同性别群体对网购满意度是否有差异。
从上表可以看出：不同性别样本对于网购满意度全部均呈现出显著性(p<0.05)，意味着不同性别样本对于网购满意度均有着差异性。具体分析可知：性别对于网购满意度呈现出0.01水平显著性(t=-13.816，p=0.000)，以及具体对比差异可知， 女的平均值(0.50)，会明显低于男的平均值(1.63)。总结可知：不同性别样本对于网购满意度全部均呈现出显著性差异。
（2）配对t检验
进行比较两组配对数据的差异。
SPSSAU分析背景：以体育疗法治疗高血压，10个高血压患者在施以体育疗法前后测定舒张压，研究体育疗法对高血压是否有效。（案例来源于：SPSS统计分析 第5版）
从上表可以看出：总共1组配对数据，均会呈现出差异性(p<0.05) 。具体分析可知：治疗前舒张压和治疗后舒张压之间呈现出0.01水平的显著性(t=5.639，p=0.000)，以及具体对比差异可知，治疗前舒张压的平均值(119.50)，会明显高于治疗后舒张压的平均值(102.50)。