（1）染色体异常
主要根据胚胎染色体和夫妇双方外周血染色体核型分析，以明确是胚胎的染色体异常，还是父源性或母源性的染色体异常。
（2）内分泌功能检查
临床上主要根据患者月经周期情况、基础体温、全套性激素测定、子宫内膜活检以及甲状腺功能和血糖检测等，以了解是否存在黄体功能不全或其他内分泌疾病。黄体功能不全的实验室诊断依据为：
子宫内膜活检显示子宫内膜发育落后于月经周期天数2 天或以上。
① 孕激素。黄体期测定24 小时尿孕二醇， 正常值为6 ～ 22μmol，小于下限者为黄体功能不全。黄体期血清孕二醇峰值为20.7 ～ 102.4nmol/L，低于16nmol/L 者为黄体功能不全。妊娠后孕激素水平持续升高，孕7 周为（76.4±23.7）nmol/L，8 周为（89.2±24.6）nmol/L，9 ～ 12 周为（18.6±40.6）nmol/L，13 ～ 16 周为（142.0±4.0）nmol/L。值得指出，孕酮测定个体差异较大，而且每天不同时间测定其值也存在差异，故测定值只能作为参考。孕激素水平低下易发生流产。有报道，孕酮单一指标测定预测宫内胎儿存活的敏感性和特异性均为88%。 Hahlin 等报道，83% 的自然流产患者存在血清黄体酮值低，黄体酮水平低于31.2nmol/L 则提示胚胎已死亡。
②人绒毛膜促性腺激素（HCG）。一般妊娠后8 ～ 9 天在母血中即可测出HCG，随着妊娠的进程，HCG 逐渐升高，早孕期HCG倍增时间为48 小时左右，孕8 ～ 10 周达高峰。血清β -HCG 值低或呈下降趋势，提示可能发生流产。
③人胎盘催乳素（HPL）。HPL 分泌与胎盘功能密切相关。妊娠6 ～ 7 周时，血清HPL 正常值为0.02mg/L，8 ～ 9 周为0.04mg/L。
HPL 低水平常常是流产的先兆。
④宫颈黏液。如涂片中见到羊齿状结晶，提示预后不良。
⑤阴道细胞学检查。阴道涂片中见有绒毛合体细胞，流产的发生率几乎达到100%；因此，此法可以预测流产的转归，一旦出现此种细胞宜及早终止妊娠。
合体细胞在涂片上的特点是：细胞大小不等，胞质嗜碱性，含有不同数目的深染色细胞核，常被红细胞和白细胞包围。
⑥甲状腺素和血糖测定。甲状腺功能低下和亢进均易发生流产。
核素测定游离T3 和T4 有助于孕期甲状腺功能的判断。正常空腹血糖值为5.9mmol/L，异常时应进一步做糖耐量试验，排除糖尿病。
（3）感染有关检查
应包括弓形虫（TOXO）、巨细胞病毒（CMV）、沙眼衣原体（CT）、人支原体和解脲支原体（MH，UU）等的检查。
（4）免疫检查
①自身免疫型复发性流产。患者排除胚胎及夫妇外周血染色体核型、生殖道感染、内分泌及生殖器官解剖等异常情况。自身抗体检测阳性。常有2 种情况：抗磷脂抗体（ACL，LCA）阳性；抗核抗体（ANA）和可抽提核抗原抗体（ENA）阳性。
②同种免疫型（不明原因性）习惯性流产。经染色体、解剖、内分泌和感染等方面病因筛查未见有任何异常；各种自身抗体阴性；封闭抗体缺乏，微量淋巴细胞毒试验（LCT）阴性，单向混合淋巴细胞培养（MLC）+ 抑制试验表明为增殖抑制明显降低。