有机化学中的命名通常遵循一定的规则和体系，以下是一些关于有机化合物命名的基本原则：
选择主链：根据分子的结构特征，选择含有最多碳原子的碳链为主链。
确定编号：从主链的某一端开始，依次给主链碳原子编号。
确定取代基：按照顺序规则，确定取代基的优先次序，并将其编号。
写名称：先写取代基，再写主链碳原子编号，最后加上母体名称。
以1,3-二磷酸甘油酸为例：
主链：该分子中最大的碳链含有6个碳原子，为主链。
编号：从左端开始，依次给主链碳原子编号，则为1号碳、2号碳、3号碳……直至6号碳。
取代基：分子中有两个磷酸基团，分别在1号碳和3号碳上。
写名称：先写取代基，再写主链碳原子编号，最后加上母体名称。所以该化合物的命名为“1,3-二磷酸甘油酸”。
关于酸的判断，一般来说，含有羧基（-COOH）的化合物都可以被认为是酸。在有机化学中，羧基是定义为包含一个碳、一个氧和一个氢的基团，其中碳和氧之间形成一个双键，碳和氢之间形成一个单键。这个定义可以用于判断大多数有机酸。然而，也有一些特殊的酸类，如磺酸、磷酸等，它们虽然不直接包含羧基，但仍然被视为酸。