保护地栽培黄瓜常见病害有霜霉病、白粉病、炭疽病、枯萎病、细菌性角斑病、疫病、灰霉病、黑星病、病毒病等。
（1）霜霉病 黄瓜主要病害之一，俗称“跑马干”，属真菌性病害，主要危害叶片。发病一般从中下部叶片开始，开始叶片出现水浸状斑点，斑点扩大后受叶脉限制，因此病斑多呈不规则多角形。斑点逐渐呈黄褐色，潮湿条件下，叶背面病斑有紫黑色霉，严重时病斑连成片，全叶枯黄。
阴天多雨、湿度大、氮肥不足的情况下，易发此病，发病适温为20～24℃。该病发病后迅速传播，危害严重，应及时防治。
预防霜霉病首先要选用抗病品种；其次要注意调节棚内湿度，注意通风散湿；可进行叶面追肥，增加植株的抗病能力。植株发病后应进行药剂防治。药剂防治以使用百菌清烟雾剂效果好（兼防白粉病、炭疽病等多种病害），操作简便，布药均匀，尤其在阴雨天湿度大时应用不会进一步增加室内湿度。具体做法是每立方米空间用药0.1～0.2克（以有效成分计算），55%的百菌清烟雾剂每亩用300克左右。为布药均匀，可在棚内设5～6个燃烧点。还可用75%的百菌清可湿性粉剂600倍液，40%的乙膦铝可湿性粉剂300～400倍液，65%的代森锌可湿性粉剂500倍液，25%的甲霜灵锰锌可湿性粉剂400～600倍液，25%的瑞毒霉可湿性粉剂600倍液喷雾。
（2）白粉病 俗称“白毛”，真菌性病害。该病在保护地内发病严重，主要危害叶片。初发病时，叶片产生圆形白色粉状小斑点，叶片正面分布较多，斑点扩大后连成片，似白粉，后期白粉斑变为褐色斑，病叶枯黄。
该病流行温度为16～24℃，通风不良，湿度大，氮肥过多或过少，植株生长不良，高温干旱与高温高湿交替发生易引发病害。
预防白粉病首先应选用抗病品种，进行通风散湿，避免湿度变化剧烈，合理施用氮肥。发病后可用15%的粉锈宁可湿性粉剂或20%的粉锈宁乳油1500～2000倍液，75%百菌清可湿性粉剂600倍液，50%代森铵可湿性粉剂800～1000倍液喷雾防治。
（3）炭疽病 真菌性病害，该病危害黄瓜叶、茎及果实。幼苗发病，子叶边缘出现褐色圆形或半圆形病斑。叶片受害后产生圆形黄褐色病斑，病斑上有同心轮纹，病重时病斑连成片，全叶枯黄。茎上发病病斑凹陷，绕茎蔓延，并生出许多小黑点。果实发病后病斑稍凹陷，呈圆形，表面有粉红色黏液。
炭疽病发病适温为24℃，湿度为97%以上。湿度大，叶面结水，瓜类重茬，氮肥过多均可造成病害的发生和蔓延。
预防炭疽病要选抗病品种，播种前进行种子消毒，种植黄瓜的地块应与瓜类蔬菜实行3年以上的轮作，进行合理的配方施肥，加强保护地内的通风排湿，适当控制浇水。药剂防治可用50%炭疽福美可湿性粉剂300～400倍液，50%甲基托布津可湿性粉剂500倍液，70%代森锰锌可湿性粉剂400倍液，75%百菌清可湿性粉剂600倍液喷雾。
（4）枯萎病 也叫萎蔫病、蔓割病。真菌性病害，对保护地黄瓜危害严重，采用嫁接苗栽培可有效防止此病的发生。
幼苗发病后子叶变黄，不久便干枯，根部和茎部变褐。成株发病一般在根瓜采收后，茎基部叶片首先出现病状，病叶中午萎蔫下垂，早晚恢复正常，似缺水状，叶色变淡，以后遍及全株。病株主蔓基部软化缢缩，初呈水浸状，以后逐渐干枯，全株死亡。
该病在15℃以上开始发病，20～30℃为发病盛期。土壤水分忽干忽湿或土壤过干，氮肥过多，有机肥未完全腐熟，连作生产等均易引发病害。
枯萎病应以预防为主。选用抗病品种，实行嫁接防病。育苗时在播种后土壤喷药或撒药预防，定植时在沟内用药，发现个别植株发病后，用50%多菌灵500倍液或50%甲基托布津400～600倍液灌根，每株用药液0.25～0.5千克。
（5）细菌性角斑病 细菌性病害，叶、茎及瓜均可发病。幼苗发病，子叶上形成水浸状稍凹陷圆形病斑，后变黄褐色。成株发病，叶片病斑初为水浸状，后变至淡褐色，周缘有黄色晕圈。病斑因受叶脉限制呈多角形，湿度大时，病部叶背面溢出白色黏液，干枯后易破裂、穿孔。瓜及茎部发病初为水浸状稍凹陷病斑，严重时裂口、腐烂，从病部流出白色黏液。
本病在低温、高湿时极易蔓延。昼夜温差过大，结露严重，浇水过多时易发病。
为预防此病，播种前应进行种子消毒。采用高垄、地膜栽培，降低空气湿度，减轻病害发生。发病后可用30%DT杀菌剂500倍液或70%DTM可湿性粉剂500～600倍液，25%瑞毒铜600～800倍液，200单位的农用链霉素或新植霉素喷雾。
（6）疫病 真菌性病害，叶、茎、瓜均可发病。幼苗期嫩茎部最易发病，病部水浸状，缢缩，1～2天内萎蔫、青枯死亡，但不倒伏。成株多在嫩茎及节上发病，病部水浸状、软化、缢缩，其上部萎蔫下垂。叶片发病后出现暗绿色、水浸状、边缘不明显的圆形大斑，天气潮湿时迅速扩大，发展到叶柄。果实多从触地处发病，病部水浸状凹陷，并很快腐烂，表面长出白霉并有臭味。
疫病发病适温为25～30℃，要求高湿环境。浇水过多、瓜类重茬、土壤黏重时发病重。
预防疫病应实行4年以上的轮作，采用嫁接栽培，发现病株后及时清除并喷药防治。药剂防治可用25%的甲霜灵可湿性粉剂800倍液，75%的百菌清可湿性粉剂600倍液，64%杀毒矾M8可湿性粉剂400～500倍液，40%乙膦铝可湿性粉剂300倍液喷雾。也可用70%敌克松1000倍液或25%甲霜灵可湿性粉剂600倍液灌根，每株灌药0.2～0.5千克。
（7）灰霉病 真菌性病害，主要危害幼瓜。雌花及幼瓜发病时呈水浸状腐烂，表面密生灰色至淡褐色霉层。叶部发病多由病花引起，发病时形成灰褐色圆形大病斑，表面亦生灰色霉层。
本病发病适温为22℃，棚内湿度大时发病严重。
栽培时应进行种子消毒，采用嫁接苗，及时摘除病花、病果、病叶。
药剂防治可用50%速可灵可湿性粉剂1500～2000倍液，50%扑海因可湿性粉剂1500倍液，50%托布津可湿性粉剂500倍液喷雾。灌根可采用25%瑞毒霉500倍液，或25%瑞毒霉与40%福美双1：1混合剂500倍液灌根，每株灌200～250毫升，每7～10天灌1次。
（8）黑星病 为近年来发生的一种新病害，属真菌性病害。
全生育期均可发病，危害叶、茎、瓜。幼苗发病子叶发生病斑，严重时心叶枯死。茎受害初期呈水浸状浅绿色圆形，或不规则形条斑，以后凹陷龟裂，表面密生黑色霉层，严重时病部腐烂。生长点染病后可在2～3天内烂掉，造成秃顶，使下部丛生侧枝。瓜条发病后瓜向病斑内侧弯曲。
黑星病发病需要较低的温度和较高的湿度。17℃左右的温度，90%以上的湿度会造成此病流行。阴雨天气、通风不畅，植株密度大、光照不足的条件下易发病。
预防黑星病应实行轮作，采用种子消毒措施，控制浇水，进行通风排湿。发现田间有病株后，用50%多菌灵可湿性粉剂600倍液，农抗BO-1O浓度100单位，70%代森锰锌500倍液喷雾。喷药时应注意不能只喷叶片，还要喷嫩茎及生长点附近，每5～7天喷药1次，连喷3次。
（9）病毒病 属病毒性病害。植株发病后矮化，果实发病后瓜面出现花斑或凸凹不平的瘤状物，瓜畸形，严重时病株枯死。
根据病原不同，叶片出现的症状不同，叶片感病后有皱缩型、绿斑型、花叶型和黄化型，有时表现复合症状。
皱缩型：新生叶片沿叶脉出现浓绿色隆起皱纹，或出现叶片变小，裂片现象，有时出现沿叶脉坏死。
绿斑型：新叶产生黄色斑纹，绿色部分呈隆起瘤状。
花叶型：叶片出现淡黄色不明显斑纹，后呈现浓淡不均匀的小型花叶病斑。
黄化型：叶片变黄绿至黄色，叶脉仍绿。病叶硬化，向叶背卷曲。
此病病原为多种病毒，病毒主要在杂草上越冬。通过蚜虫传播，农业操作时汁液摩擦亦可传毒。高温干旱，蚜虫猖獗时发病重。
防治病毒病应进行种子消毒，进行防蚜灭蚜，病前或病初用植病灵800～1000倍液全株喷雾。