在使用食用色素时，首要的是确保选用的是经国家批准的合格产品。这些色素的使用量和适用范围应严格遵守国家规定的标准，特别是要考虑到国标上限量是基于100%色素含量计算的，实际使用时需要根据色素的实际含量进行相应调整。对于初次使用，建议进行小规模的实验以确保安全和效果。
调配色素溶液时，直接使用粉末可能会导致色素分布不均，形成色斑。正确的做法是先用少量冷水打浆，然后在不断搅拌下加入煮沸后的溶液中。为了保证色素的均匀分布，使用蒸馏水或软化水，避免钙、镁离子引发沉淀。同时，调配和储存过程需使用耐腐蚀的玻璃、搪瓷或不锈钢容器，避免与铜、铁等金属接触，以免影响色素的稳定性。
针对不同食品类型，色素的使用也有其特殊要求。例如在饮料中，要确保水质纯净，选择水溶性好的色素以保持产品清澈透明，建议选择85%含量的色素以增强稳定性。在乳化香精中，应选择85%含量、杂质少、稳定性良好的产品，特别是钙稳定型的日落黄，以防止钙沉淀的问题。
对于糖果，色素应在糖煮沸后加入，与香精同时添加，以确保均匀分布。在奶制品中，为了减少盐分对奶制品的不良影响，应优先选择85%含量的色素。在烘焙和果酱中，需要耐高温且能抵抗果酸和二氧化硫的色素，最好在煮沸后温度下降时加入，溶解度高的色素更适合。而对于罐头食品，选择耐热、耐酸的色素，如使用赤鲜红在樱桃罐头中着色，能防止色素渗入罐头溶液。
食用色素，是色素的一种，即能被人适量食用的可使食物在一定程度上改变原有颜色的食品添加剂。食用色素也同食用香精一样，分为天然和人工合成两种。