变更宅基地使用权应由用地者填写变更土地登记申请书，说明变更依据和变更内容，同时提供证明材料，根据土地变更登记申请的内容项目进行实地调查审核权属并进行地籍测量，审核通过后更换土地证书。
【法律依据】
《城市房地产管理法》第十八条
土地使用者需要改变土地使用权出让合同约定的土地用途的，必须取得出让方和市、县人民政府城市规划行政主管部门的同意，签订土地使用权出让合同变更协议或者重新签订土地使用权出让合同，相应调整土地使用权出让金。
《民法典》第五百零二条
依法成立的合同，自成立时生效，但是法律另有规定或者当事人另有约定的除外。
第五百四十三条
当事人协商一致，可以变更合同。
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