网上交农村合作医疗保险的方式有农村合作医疗APP缴费、农村合作医疗微信缴费。
1、农村合作医疗APP缴费
进入全国社保局在线查询，选择地方官网进入并下载当地人社app，也可以登录所在区人力资源社会保障局官网，然后在官网首页扫码下载某某地人社手机APP，下载并安装到手机上后，点击城乡居民医保缴费选项，然后点击继续。
登入个人账号，准确无误地输入身份证号码，并选择缴费年度；确认缴费信息无误后，点击确认缴费，最后选择支付应交费用即可。
2、农村合作医疗微信缴费
先打开手机微信，点击右下角我，点击支付，进入生活缴费，选择城市，再点击社保缴费即可，目前只有部分城市开通了这项功能，可以留意自己的微信有没有这项功能。
农村合作医疗保险是指由政府组织、引导、支持，农民自愿参加，个人、集体和政府多方筹资，以大病统筹为主的农民医疗互助共济制度。采取个人缴费、集体扶持和政府资助的方式筹集资金。
农村合作医疗是由我国农民自己创造的互助共济的医疗保障制度，缓解农民因病致贫和因病返贫方面发挥了重要的作用。