第一，房屋不会被强拆，如果说宅基地面积超标，一般都是属于历史遗留问题，对以前的老房子超标部分，只要不是违章建筑，是不会不强制拆除的。
第二，对于宅基地的确权不会有影响，大多数地方在进行宅基地确权的时候，会对宅基地的面积进行测量，若计算超标了国家有在这方面的相关规定。
一、宅基地面积超出多少标准算违建
1、根据法律规定，农村宅基地不管超出多少，超出的部分就算违章建筑，只能在宅基地证规定的面积内建住宅。农村村民一户只能拥有一处宅基地，宅基地面积标准包括附属用房、庭院用地，使用耕地最高不得超过125平方米，使用其他土地最高不得超过140平方米，山区有条件利用荒地、荒坡的，最高不得超过160平方米。宅基地的用地面积限额为三人及以下的面积应不超过75平方米，四人的面积应不超过100平方米，五人的面积应不超过110平方米，六人及以上的面积应不超过125平方米。使用非耕地的，每档最高可增加15平方米，山区有条件利用荒坡、荒山建房的，每档最高可增加35平方米。实施旧村改造、下山移民拆除面积超出用地限额20平方米以上的，可放宽一个档次的用地限额；
2、随着国家提出宅基地的节约化使用这一概念以来，我国多地都出台了较为严格的建房标准，尤其是在建房层高上，制定了明确上限，即农村房屋的垂直层数不能超过3层且每层限高为3.3米。也就是说，当农房总高度超过9.9米，就有可能被拆。而且即便农民的建房总高没有超过9.9米这一上限，但层数超过3层同样违规。
二、农村宅基地面积标准超出后，处理如下
1、农村村民未经批准或者采取欺骗手段骗取批准，非法占用土地建住宅的，由县级以上人民政府土地行政主管部门责令退还非法占用的土地，限期拆除在非法占用的土地上新建的房屋；
2、超过省、自治区、直辖市规定的标准，多占的土地以非法占用土地论处。
法律依据
《中华人民共和国土地管理法》
第六十二条 农村村民一户只能拥有一处宅基地，其宅基地的面积不得超过省、自治区、直辖市规定的标准。
人均土地少、不能保障一户拥有一处宅基地的地区，县级人民政府在充分尊重农村村民意愿的基础上，可以采取措施，按照省、自治区、直辖市规定的标准保障农村村民实现户有所居。
农村村民建住宅，应当符合乡(镇)土地利用总体规划、村庄规划，不得占用永久基本农田，并尽量使用原有的宅基地和村内空闲地。编制乡(镇)土地利用总体规划、村庄规划应当统筹并合理安排宅基地用地，改善农村村民居住环境和条件。
农村村民住宅用地，由乡(镇)人民政府审核批准;其中，涉及占用农用地的，依照本法第四十四条的规定办理审批手续。
农村村民出卖、出租、赠与住宅后，再申请宅基地的，不予批准。
国家允许进城落户的农村村民依法自愿有偿退出宅基地，鼓励农村集体经济组织及其成员盘活利用闲置宅基地和闲置住宅。
国务院农业农村主管部门负责全国农村宅基地改革和管理有关工作。
第七十七条 未经批准或者采取欺骗手段骗取批准，非法占用土地的，由县级以上人民政府自然资源主管部门责令退还非法占用的土地，对违反土地利用总体规划擅自将农用地改为建设用地的，限期拆除在非法占用的土地上新建的建筑物和其他设施，恢复土地原状，对符合土地利用总体规划的，没收在非法占用的土地上新建的建筑物和其他设施，可以并处罚款;对非法占用土地单位的直接负责的主管人员和其他直接责任人员，依法给予处分;构成犯罪的，依法追究刑事责任。
超过批准的数量占用土地，多占的土地以非法占用土地论处。
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