中医学理论体系初步形成于战国至两汉时期，《黄帝内经》、
《伤寒杂病论》、《神农本草经》等医学专著的成书，标志着中医学理论体系的初步形成。汉代以后的医学理论与实践的发展，又逐渐充实和完善了这一理论体系。
中医学理论体系的形成和确立，经历了一个漫长的历史时期。战国以降，社会的急剧变革和学术的百家争鸣，为医学理论体系的形成创造了有利的社会文化氛围。
此时，古代医家也加速了对人体自身奥秘及人与自然关系的探讨，力图将医学的经验上升为理论。他们在吸收了诸子学说中的精华部分，在医学实践与
解剖学成就的基础上，创立了藏象、经络、气血津液精神等学说，并在探讨人与自然关系的过程中创立了六淫致病学说；
同时又将古代哲学的气、阴阳、五行诸学说引入医学领域，作为方法论用以阐释人体的生理和病理，指导疾病的诊断和防治。于此建立起中医学理论体系。
战国至
秦汉时期，是中医学理论体系的形成时期。这一时期问世的《黄帝内经》、
《难经》、《伤寒杂病论》、《神农本草经》等医学典籍，标志着中医学理论体系的确立，即理、法、方、药体系的基本形成。