脏腑慢性疾病因其病因不同，且病史较长，发病缓慢，病理错综复杂，受损脏腑经络轻重不一，因此，在治疗上也变化多端，没有固定的套路和模式，必须遵循中医“辨证论治”的基本原则。下面简要谈谈在使用段氏脏腑按摩疗法治疗脏腑慢性疾病过程中一般遵循的思路。
1、必须树立中医学的整体观念
中医学认为，人体是一个有机整体，局部和整体之间保持着相互制约、相互协调的关系。因此，治疗疾病必须着眼于全局，要从整体出发，全面了解和分析病情，不但要注重病变的局部情况、病变所在脏腑的病理变化，而且更要注重病变脏腑与其他脏腑的关系，把握整体阴阳气血失调的情况，并从协调整体阴阳、气血、脏腑平衡关系出发，扶正祛邪，消除病邪对全身的影响，切断病邪在机体脏腑之间所造成的连锁病理反应，通过整体作用于局部，从而达到消除病邪、治愈疾病的目的，避免“头痛医头，脚痛医脚”。
2、腹部是脏腑按摩的重点治疗部位
“腹为万病之机，治疗万病全在治疗腹部”，因此段氏脏腑按摩疗法始终把对腹部治疗的作为治疗各种脏腑慢性疾病的重点。
“六腑”中的胆、胃、小肠、大肠、膀胱和三焦中的两焦均位于人体腹腔内，五脏中的脾、肝、肾三脏位于腹腔内。脏和腑通过经络相互联系，在生理相互联系，在病理上则相互影响，脏病及腑，腑病及脏，脏腑同病。不但六腑的病变会在腹部体现，五脏发生病变，亦皆可从腹部反映出来。不同脏器的发生病变时，除其本身内发生气血瘀滞外，其周围的组织也会受到影响，并在腹腔内相应部位也会形成气血的瘀滞，就是中医所说的“积聚”或“症瘕”。五脏生病时，在腹部的相应部位会产生气血的瘀滞，形成硬块或条索，实际上这些相应部位就是五脏在腹部的“反射区”。如心病者，在腹部心口窝部位，常可触到肌肉板硬或硬块，按之患者有痛感或胸闷的感觉，另外，因小肠与心互为表里，心脏病变有时还会影响到小肠，导致小肠功能失调或发生病变，按小肠亦有痛感；肝病者，如肝气郁滞日久，形成气滞血瘀之证，在右胁肋下可触及硬块，按之刺痛，腹部右侧肌肉会板滞硬结；脾病者，在胃脘部或左季肋下会产生硬块或条索，若脾被湿邪所困，在胃脘部会积滞大量的液体等；肾病者，患者脐部周围及少腹部会触到按之刺痛的硬块；肺病者，如肺失清肃，津液不能下达，因大肠与肺相为表理，可见乙状结肠病变。
因此，过对腹部的脏腑器官和病灶按摩治疗，不但可以直接作用于脾胃，改善和提高脾胃受纳、运化、升清、排泄的功能，促进气血生成、废物排出，对局部起到治疗作用，而且能够消除其他患病脏腑在腹部形成的病灶，达到治疗患病脏腑的目的。
