在商鞅的改革中，贵族的利益是其触碰的核心，土地、爵位、封邑以及世袭特权都被“商鞅变法”所触及。在“井田制”的八私一公的土地分配形式上，将贵族享有的一公也收回，分配给农民，国家从中收取更多的税负；在爵位方面，贵族子弟不参与战争立功，就不能再世袭家族的爵位；
在封邑方面，贵族原有的封邑都收回给国家，只有在战场上立功才能获得封邑。而相对于平民来说，立军功就是“野鸡变凤凰”的途径，只要军功多，官职、田地、爵位、封邑都会有的。这就打破了秦国自建国以来的利益分配模式，无疑是贵族最痛恨的地方。屈原当初在楚国的改革不也是因为触碰了贵族利益才走投无路吗？
当商鞅实行新法的时候，贵族们水土不服，犯法者居多，商鞅深知“法之不行，上之不效”的道理，于是对贵族大下狠手，即便是太子犯法，也要追究责任，太子老师公子虔被商鞅割去了鼻子，这也更将商鞅推向了贵族以及太子的对立面。
当太子即位以后，商鞅没有了秦孝公这个保护伞，贵族们便开始了疯狂的报复行动，谗言无数，那个被割去鼻子的公子虔更是告发商鞅要谋反，面对秦国已经步入正轨的形势下，秦惠文王也就不再害怕失去商鞅这位新法的创始人，借着臣下的诬告，将商鞅处死以解当年的法不留情之仇。
而本可以逃跑的商鞅却被故国魏国挡住了去路，原因是商鞅在伐魏之时不顾名声的引骗好友公子卬，打败魏国大军，使其丧失河西六百里之地，这等深仇大恨，魏国又怎能让你借道逃走？商鞅也就这样被逮捕回咸阳，秦惠文王也以商鞅创立的车裂之刑处死了商鞅。
商鞅的变法给秦国的强大奠定了基础，但也因变法而死，虽然有点讽刺，但这就是改革家的伟大之处，牺牲一人换来了秦国一统天下的局面。而这种讽刺并未结束，秦国统一之后仍延用法家的冷酷思想治国，以致天下大乱，争相反秦，最终由汉家获得了大一统的成果。
商鞅为秦强而死于秦强，秦因商鞅强也因商鞅而亡，天道轮回，商君得以瞑目邪。