根据你的问题描述，你应该是不服人民法院已经发生法律效力的刑事判决、裁定而申诉的，检察院受理刑事申诉案件三个月，还不能说是否一定提出抗诉。
根据《人民检察院复查刑事申诉案件规定》：
第二十二条 审查结案的案件，应当将审查结果告知申诉人。对调卷审查的，可以制作刑事申诉审查结果通知书，并在十日以内送达申诉人。
第二十四条 审查刑事申诉，应当在受理后二个月以内作出审查结案或者立案复查的决定。
调卷审查的，自卷宗调取齐备之日起计算审查期限。
重大、疑难、复杂案件，经部门负责人或者检察长批准，可以适当延长审查期限。
一般来说，刑事申诉被受理二个月内，会有一个审查结果，如果不符合立案复查条件，会审查结案，并通知申诉人。如果符合立案复查条件，会立案复查。三个月后没有通知你，一般情况是进入了立案复查阶段了，除非案件比较重大、疑难、复杂，延长了审查期限。
第三十六条 复查刑事申诉案件，应当在立案后三个月以内办结。案件重大、疑难、复杂的，最长不得超过六个月。
第五十五条 对不服人民法院已经发生法律效力的刑事判决、裁定的申诉复查后，不论是否决定提出抗诉或者提出再审检察建议，立案复查的人民检察院均应制作刑事申诉复查通知书，并在十日以内送达申诉人。
而立案复查后，有三个月的办案时间，最长可以达到六个月。时间长不代表一定会提出抗诉，但最终复查结果会通知申诉人。
所以，现在应该问一下检察院，你的申诉是处于受理审查阶段还是立案复查阶段。