一、形式不同
1、双轨：即上下行列车分别在各自的正线上行驶的铁路；而对有两条以上正线的铁路为多线铁路。
2、单轨：车辆跨骑在单片梁上运行的方式；车辆悬挂在单根梁上运行的方式。
二、特点不同
1、双轨：方向相反的列车在不同轨道上行驶。
2、单轨：因其占地面积很少，与其他交通方式完全隔离，运行安全可靠，建设适应性较强。
三、应用不同
1、双轨：适用于干线铁路或客运铁路。
2、单轨：单轨系统适用于单向高峰小时最大断面客流量1.0~3.0万人次的交通走廊。
参考资料来源：
百度百科-单轨
百度百科-双轨