1、平台不同
巫师2游戏平台有PC/XBOX360。
巫师三平台有WB Games（NA）、Spike Chunsoft（JP）。
2、战斗系统不同
巫师2：
战斗系统混合了许多策略元素和动态战斗过程。
改进后的锻造系统可使玩家拥有自己的特色物品，共有200种武器及盔甲可供把玩，单是剑类武器就有300种变化，而原作只有区区十把剑。盔甲可细分为多个组成部分。背心、手套、腰带、护膝等等每一片都可独立升级，从而提供更多可供深究的组合，而原作只有区区四种盔甲。即便是相似物品，也因导入随机属性而变得大相径庭。人物所携带的物品数量无上限，物品分类也有改进。
巫师3
游戏以即时类战斗为基础，游戏角色需要根据不同的敌人制定相应的应对策略。面对人类和类人生物需要使用钢剑，对付怪物时则需要使用银剑。拔剑后即进入战斗状态，系统将自动锁定离主角最近的目标。通过物理攻击、法印和相应的躲避方式来进行作战。游戏中根据怪物的类型，可搭配不同的魔药、剑油进行有效的伤害。如果敌人的等级过高，可在战斗前先完成支线任务，获得经验值和更好的装备使角色有更高机率赢得战斗。
3、背景不同
巫师2
在粉碎蔷薇骑士团的造反企图并救了国王一命后，杰洛特成为王国政治漩涡中的核心人物之一。为迎来持久和平，他必须铲除王国版图中最后一个反抗堡垒，即宣布独立的Baroness La Valette城堡。在国王的军队进发至叛军堡垒大门外准备进攻之时，一名巫师级别的杀手也悄然而至，试图行刺国王，而杰洛特为了保护国王也无法抽身去调查刺客的身世及委托方，而这才是问题的关键。
玩家在本作中将继续扮演杰洛特，逆庞塔尔河而上，只身前往三国交界处（Temeria、Kaedwen，及Aedrin）卷入世上最强武力的纷争中……
巫师3
游戏延承了《猎魔人》系列小说的世界观。在小说故事发生前1500年前发生的一场灾难，不同的维度之间的世界发生了碰撞，世界直接被连接并互相渗透。这场灾难被称为“天球交汇”，它让很多来自各式各样来自不同世界中的生物被困在这个世界中，例如，食尸鬼和血棘尸魔和高阶吸血鬼，它们就是天球交汇所留下的残物。这些生物带有自己独特的生态，是过去时代的遗种。根据精灵的传说，人类因为自己之前的世界被毁灭，来到了这个世界。
人类的祖先学会了如何驾驭混沌之力，最早的人类法师从此诞生，并对抗着其他来自不同世界的生物。但由于怪物四处散布且难以击败，在普通人不具备与怪物对抗的情况下，猎魔人由此孕育而生，他们是专门被普通人雇佣来猎杀怪物的变种人类，并以此维持生计，保护人们不受怪物威胁。
其次，既然是PC这种相对用户较少的平台，2代依托的本应该是同在PC的1代积累下的口碑。然而实际上，却一改1代那种环环相扣的任务网（虽然比较初级）和黑死病感之类的特质，变成了一个身处政治漩涡的游戏。加上各种系统的简化和（一开始以为的）包含序章的短短4章的流程，口碑并不是很高，也限制了其销量。虽然不一会大伙儿就发现了有两个完全不同的（从场景到任务没有丝毫的重合）第2章，但这种实际上强制二周目的做法并不来得比做线性的含序章5章节更具吸引力。
最后，3代一开始就打算上主机平台，宣传上也是不遗余力，完全是当新作来讲的。事实上很多玩家也根本不知道这个游戏还有前两代。而3代发售那个时候的一款画面精良的，动作华丽的（哪怕这个动作系统并不好玩），强故事的开放世界战斗冒险游戏是具备相当强的吸引力的。本回答被网友采纳