相同点：它们都具有细胞膜、细胞质和遗传物质。
不同点：
一、特点不同
1、原核微生物
① 核质与细胞质之间无核膜因而无成形的细胞核（拟核或类核）；RNA转录和翻译同时进行。
② 遗传物质是一条不与组蛋白结合的环状双螺旋脱氧核糖核酸（DNA）丝，不构成染色体（有的原核生物在其主基因组外还有更小的能进出细胞的质粒DNA）。
③ 以简单二分裂方式繁殖，无有丝分裂或减数分裂。
2、真核微生物
①核发育完全（有核膜将细胞核和细胞质分开，两者有明显界限）。
②有高度分化的细胞器，如线粒体、中心体、高尔基体、内质网、溶酶体和叶绿体。
③进行有丝分裂。
二、结构不同
1、原核微生物
原核生物仍拥有细胞的基本构造并含有细胞质、细胞壁、细胞膜、以及鞭毛的细胞。细胞壁不包括所有的原核生物，原核生物有一个例外：原核生物中，除了支原体，其余的都有细胞壁；支原体是唯一不具有细胞壁的原核生物。
2、真核微生物
真核细胞与原核细胞相比，个体更大，结构更复杂，显著特征是有明显的细胞核，还有一些由膜包裹的细胞器。有细胞壁的真核细胞其内部为原生质体，由细胞质膜包裹着，其中为细胞质和细胞核。细胞质是透明而黏稠的溶胶，由各种细胞器及其他物质组成。
除细胞器以外的胶状溶液为细胞浆或称细胞基质。内含细胞骨架、各种酶、储藏物质等内含物。真核微生物主要包括真菌、显微藻类和原生动物等。
三、常见分类不同
1、原核微生物
1）菌类
菌类包括细菌、放线菌和真菌；真菌又分酵母菌、霉菌和食用菌；细菌和放线菌属于原核生物，而酵母菌、霉菌（毛霉、曲霉、青霉）和食用菌（如银耳、黑木耳、灵芝、菇类）属于真核生物。
2）藻类
蓝藻（如色球藻、念珠藻、颤藻、螺旋藻）属于原核生物；红藻（如紫菜、石花菜）、褐藻（如海带）属于真核生物。
2、真核微生物
1）原生动物
原生动物是动物中最原始、最低等、结构最简单的单细胞动物。在动物学中被列入原生动物门。因其形体微小，长度在10～300 µm，需在光学显微镜下才能看到。
2）真菌
真菌的细胞构造包括细胞壁、细胞膜、细胞质、细胞核、线粒体、核糖体、内质网、高尔基体、液泡等。
参考资料来源：百度百科－真核微生物
参考资料来源：百度百科－原核生物
原核微生物和真核微生物的不同：
一、有无细胞核
1、原核微生物：核质与细胞质之间无核膜因而无成形的细胞核。
2、真核微生物：核发育完全（有核膜将细胞核和细胞质分开，两者有明显界限）。
二、细胞分裂方式不同
1、原核微生物：以简单二分裂方式繁殖，无有丝分裂或减数分裂。
2、真核微生物：进行有丝分裂。
三、有无细胞核
1、原核微生物：细胞质内仅有核糖体而没有线粒体、高尔基体、内质网、溶酶体、液泡和质体（植物）、中心粒(低等植物和动物)等细胞器。
2、真核微生物：有高度分化的细胞器，如线粒体、中心体、高尔基体、内质网、溶酶体和叶绿体。
四、细胞结构不同
1、原核微生物：大部分原核生物有成分和结构独特的细胞壁等等。总之原核生物的细胞结构要比真核生物的细胞结构简单得多。
2、真核微生物：真核细胞与原核细胞相比，个体更大，结构更复杂。
原核微生物和真核微生物的相同点：
1、均能进行有氧呼吸。
2、细胞中均存在遗传物质。
扩展资料
原核微生物基因组成：
原核生物基因分为编码区与非编码区。
所谓的编码区就是能转录为相应的信使RNA，进而指导蛋白质的合成，也就是说能够编码蛋白质。非编码区则相反，但是非编码区对遗传信息的表达是必不可少的，因为在非编码区上有调控遗传信息表达的核苷酸序列。
非编码区位于编码区的上游及下游。在调控遗传信息表达的核苷酸序列中最重要的是位于编码区上游的RNA聚合酶结合位点。RNA聚合酶是催化DNA转录为RNA，能识别调控序列中的结合位点，并与其结合。
真核微生物基本结构：
真核细胞个体大，结构复杂，显著特征是有明显的细胞核，还有一些由膜包裹的细胞器。有细胞壁的真核细胞其内部为原生质体，由细胞质膜包裹着，其中为细胞质和细胞核。细胞质是透明而黏稠的溶胶，由各种细胞器及其他物质组成。除细胞器以外的胶状溶液为细胞浆或称细胞基质。内含细胞骨架、各种酶、储藏物质等内含物。
参考资料来源：百度百科-原核生物
参考资料来源：百度百科-真核微生物
本回答被网友采纳（1）主要是有没有成型的细胞核.原核生物细胞有明显的核区,核区内只有一条双螺旋结构的脱氧核糖核酸（DNA）构成的染色体；原核生物细胞的核区没有核膜包围,称原核.真核生物细胞内有一个明显的核,其染色体除含有双螺旋结构的脱氧核糖核酸（DNA）外还含有组蛋白,核由一层核膜包围,称真核。
（2）细胞壁的成分（若果有的话）也不同：原核细胞是肽聚糖，真核细胞是纤维素和果胶。
（3）细胞器的种类不同：原核细胞只有核糖体；真核细胞有众多具膜包被的细胞器，当然也有核糖体。
（4）核内遗传物质的存在状态不同：原核细胞是裸露的大型环状DNA分子，基因遗传不符合孟德尔遗传定律；真核细胞与蛋白质组成染色体，且上面的基因符合孟德尔遗传定律。
（5）细胞分裂方式不同：原核细胞一般是裂殖；真核细胞可以是有丝分裂、无丝分裂等
相同点：
就是它们都具有细胞膜、细胞质和遗传物质。
纯手打，望采纳！本回答被提问者和网友采纳
不同点：原核生物无成型的细胞核（无核膜、核仁）；真核生物有成型的细胞核。
原核生物的细胞壁的成分是几丁质和葡聚糖，真核生物（植物）的细胞壁成分是纤维素和果胶；
原核生物只有一种细胞器--核糖体，真核生物具有所有的细胞器。