离婚纠纷中小产权房分割首先会由当事人协商，协商不成的，要判断是个人财产还是夫妻共同财产。如果是婚前一方所获得的小产权房就属于个人财产，如果是夫妻婚后获得的小产权房属于共同财产，一方获得房屋，需要给另外一方给予补偿。分割时会按照照顾子女、女方和无过错方权益的原则判决。
《中华人民共和国民法典》第一千零八十七条离婚时，夫妻的共同财产由双方协议处理；协议不成的，由人民法院根据财产的具体情况，按照照顾子女、女方和无过错方权益的原则判决。
对夫或者妻在家庭土地承包经营中享有的权益等，应当依法予以保护。
《中华人民共和国民法典》第一千零八十八条夫妻一方因抚育子女、照料老年人、协助另一方工作等负担较多义务的，离婚时有权向另一方请求补偿，另一方应当给予补偿。具体办法由双方协议；协议不成的，由人民法院判决。