其实刺客二兄弟会的主线剧情相对比较简短，比起直线而言本作的主线实在地的有够可以，所以我在这就忽视其中的一些支线，帮助你从戴斯蒙德与艾吉奥两个线去分析刺客2兄弟会的剧情呗~~~
戴斯蒙德剧情：戴斯蒙德作为具有先古第一文明血统的刺客，曾经被圣殿骑士组织Abstergo抓去做过实验体，意图通过他的血缘找到他先祖记忆中关于金苹果下落的片段（所谓金苹果就是那一坨游戏刚开始没多久就被boss抢走的球体）。后来戴斯蒙德被另一个刺客露西救下，并开始和另外两个刺客开始合作，准备利用装置先一步获得金苹果下落，以防落入圣殿骑士之手。在探索中戴斯蒙德接连获取重要信息，最终通过奥迪托雷庄园中艾吉奥留下的讯息在古罗马斗兽场的密道中找到金苹果，但当戴斯蒙德拿到金苹果时，第一文明的先民朱诺开始操纵戴斯蒙德让他杀死露西，之后戴斯蒙德陷入更深的昏迷，开始了对艾吉奥以后人生的探索...（注：露西是圣殿骑士中的一员，是刺客组织中的叛徒，所以朱诺才会操纵戴斯蒙德杀掉露西。）
艾吉奥剧情：紧接着二代的剧情，艾吉奥成功打败教皇亚历山大六世罗德里戈·波奇亚，并获得金苹果与权杖，开启了第一文明遗迹（也就是那个刚开始看起来未来感强烈的小空间），并在里面认识了朱诺，但明显朱诺的出现是给在进行记忆追述的戴斯蒙德看的，艾吉奥完全被无视一旁。之后艾吉奥在无法获得任何有用消息后，只得同叔叔马里奥回到奥迪拖雷庄园。但就在回到奥迪托雷庄园不久后，教皇的私生子凯撒.波吉亚开始率领罗马大军攻打奥迪托雷庄园，并将马里奥杀害，抢夺金苹果，重伤艾吉奥。不得已，艾吉奥只得带领仅存的百姓和家人与刺客通过密道逃出奥迪托雷庄园。艾吉奥心痛之余，立志要让波吉亚王朝彻底灭亡，于是踏上了去往罗马的旅途。
在罗马，艾吉奥先后与政坛与市民与雇佣军方面的领导人马基雅维利，拉·沃尔佩，巴托洛缪·德·阿尔维亚诺接触，并先后获得三方的支持与信赖，组建了全民抗争波吉亚王朝的战线。为了进一步瓦解波吉亚王朝，艾吉奥开始四方面的步骤（在游戏中都是以主线与支线交替的，挺乱的，给你梳理一下）：1.清除所有监视塔楼，将原来荒废的城内产业复兴，成为罗马城最大的经济操纵者（他家原来就是干金融理财的，天赋啊~~），这也包括在主线中刺杀凯撒的最大财政来源者，断绝凯撒的军队资金来源；2.解救被抓走的女领主与罗马的执政官，获得一个是外界的支持，一个是合法政府的支持，彻底使凯撒成为乱贼，众人背弃；3.招募罗马城中反抗暴政的人民，通过下水道，建立一个强大的刺客网与军事力量；4.清除凯撒依赖的寄居罗马城中的蛮族部落——罗穆里奥部落，使凯撒失去对抗起义军的后援。
在获取如此强大的力量后，艾吉奥开始准备偷取金苹果，却发现凯撒同私生父教皇间因为权力的分配上出现矛盾而争斗，甚至出现了凯撒弑父并意图杀掉与他乱伦的亲姐姐（话说凯撒就是他老爹和亲孙女的私生子，这一家...）。于是艾吉奥断定凯撒穷途末路，败局已定，开始在获取金苹果后，借由金苹果将他最后的几支军队消灭，并在罗马执政官的帮助下，流放了他。至于后来，凯撒半路逃出，开始重新纠结其他城邦的军队攻打另一座城邦时，被早已获知消息的艾吉奥率刺客赶来给消灭（历史上记载凯撒是被长矛戳死的，游戏里是艾吉奥在于它沟通物理情况下将他推下城墙，让他自己体悟生死的），就这样西欧的圣殿骑士全军覆灭，而艾吉奥建立了一个地跨欧亚非的刺客组织，建立此刻王朝。
以上就是一切剧情了，若有不解可单问~~~睡觉去罗~~~
追问看完了。
谢谢了啊！