一、层次分析法和模糊层次分析法有3点不同：
1、两者的基本原理不同：
（1）层次分析法的基本原理：层次分析法根据问题的性质和要达到的总目标，将问题分解为不同的组成因素，并按照因素间的相互关联影响以及隶属关系将因素按不同层次聚集组合。
形成一个多层次的分析结构模型，从而最终使问题归结为最低层(供决策的方案、措施等)相对于最高层(总目标)的相对重要权值的确定或相对优劣次序的排定。
（2）模糊层次分析法的基本原理：在模糊层次分析中，作因素间的两两比较判断时，如果不用三角模糊数来定量化，而是采用一个因素比另一个因素的重要程度定量表示，则得到模糊判断矩阵。模糊层次分析法是定性与定量相结合的系统分析方法。
2、两者建立的判断矩阵不同：
（1）层次分析法中建立的判断矩阵：是通过元素的两两比较建立的判断一致矩阵。
（2）在模糊层次分析法中建立的判断矩阵：通过元素两两比较建立的模糊一致判断矩阵。
3、两者求矩阵中各元素的相对重要性的权重的方法不同：
（1）在层次分析法中：检验判断矩阵是否一致非常困难，且检验判断矩阵是否具有一致性的标准CR < 0. 1缺乏科学依据；判断矩阵的一致性与人类思维的一致性有显著差异。
（2）在模糊层次分析法中：作因素间的两两比较判断时，如果不用三角模糊数来定化，而是采用一个因素比另一个因素的重要程度定量表示，则得到模糊判断矩阵。
二、模糊层次分析法的主要应用：
模糊层次分析法（FAHP）改进了传统层次分析法存在的问题，提高了决策可靠性。FAHP有一种是基于模糊数，另一种是基于模糊一致性矩阵。
模糊层次分析对于量化评价指标，选择最优方案提供了依据，并得到了广泛的应用。层次分析法最大的问题是某一层次评价指标很多时（如四个以上），其思维一致性很难保证。在这种情况下，将模糊法与层次分析法的优势结合起来形成的模糊层次分析法（FAHP），将能很好地解决这一问题。
参考资料来源：百度百科-层次分析法
参考资料来源：百度百科-模糊层次分析法