当前对精神障碍病因学及病因机制的研究，开始从生物-心理-社会等多方面综合对精神障碍的病因学进行全面的探索分析。另外，精神障碍病因学研究拥有前景也面临挑战。
一、主要病因
1、生物学因素：
（1）遗传因素：应用群体遗传学(即遗传流行病学)的研究方法对精神障碍患者进行的家系、双生子、寄养子研究证实精神障碍具有很高的遗传倾向，孤独症的遗传度高达90%，精神分裂症与双相情感障碍的遗传度也高达80%，酒精滥用/依赖的遗传度为60%，重性抑郁与惊恐障碍遗传度相对较低为40%(遗传度指群体中某一疾病可以由遗传效应来解释的部分)；研究还发现，精神障碍的遗传模式并不符合孟德尔遗传规律，属于复杂的多因素遗传疾病。
（2）神经生化因素：通过已有药物对精神障碍的有效治疗，发现单胺类神经递质、氨基酸类神经递质可能参与了精神障碍的发病机制，而对神经肽及神经营养因子的深入研究，提示这两类物质也极有可能参与了精神障碍的病理生理过程。
（3）内分泌因素：内分泌系统受到神经系统的下丘脑调节，反过来神经系统也接受内分泌系统的调节，两者关系非常密切。内分泌功能障碍与精神障碍特别是情感障碍的高共病率现象，提示神经内分泌紊乱与精神障碍发生发展可能相关。
（4）神经发育异常：精神发育学说认为，神经发育障碍患者的大脑从一开始就未能有正常的发育，由于遗传和某些精神发育危险因素相互作用，在胚胎期大脑发育过程中就出现了某些神经病理改变，这些改变的即刻效应并不显著，随着进入青春期或成年早期，在外界环境因素的不良刺激下，最终导致疾病的发生。
（5）感染：早在20世纪早期，我们就已知道感染因素能影响中枢神经系统，产生精神障碍。例如通过性传播的梅毒螺旋体首先引起生殖系统症状，在多年的潜伏后，进入脑内，导致神经梅毒。神经梅毒主要表现为神经系统的退行性变，表现为痴呆、精神病性症状及麻痹。
2、心理、社会因素：心理、社会因素既可以作为原因因素在精神障碍的发病中起重要作用，也可以作为相关因素影响精神障碍的发生、发展，还可以在躯体疾病的发生、发展中起重要作用。临床上，与急性应激有关的精神障碍主要有急性应激反应和创伤后应激障碍。此外，不同人格特征患精神障碍的可能性不同。
二、诱发因素
1、移民、少数民族：相关研究发现精神分裂症在种族冲突严重、流动人口多、社会组织混乱的内城区发病率最高。荟萃分析结果显示，少数民族身份可能是精神障碍发病的病理因素之一。少数民族群体与精神障碍的相关性在第一代移民和第二代移民中均有发现，而且在未移民的少数民族中也有发现，说明移民身份和少数民族身份介导精神障碍发病的机制可能存在差异。
2、城市化环境：相关结果显示儿童青少年期在高城市化环境中暴露的时间越长，个体在成年期罹患精神障碍的风险就越高，且两者存在一定的量效关系。这提示城市化暴露在精神障碍病因学中可能存在重要作用。
3、儿童期创伤：相关研究发现儿童期的性虐待和躯体虐待和成年期的幻觉、妄想和思维障碍相关。
4、大麻使用：大麻的使用和精神障碍大麻的使用不仅和精神分裂症相关，随机试验研究显示，D-9-四氢大麻酚(大麻中主要的致精神症状成分)在健康志愿者中可以引起短暂的精神症状和认知功能损害，有遗传风险的个体表现出更为显著的精神病性反应。
5、其他：引起精神障碍的因素还可能有外伤、饮酒、孕期伤害、癌症等因素影响。
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