法律分析：员工违反保密协议可能需要承担民事责任、行政责任和刑事责任。其中民事责任可以分为违约责任和侵权责任。员工违反保密协议很可能同时侵犯了用人单位的商业秘密，给用人单位造成了实际损失。因此，用人单位可以要求员工承担违反保密协议约定的违约责任，如果保密协议中约定了违约金，则用人单位可以要求违约的员工支付违约金。如果违约金过高或过低，双方可以要求适当降低或提高。
法律依据：《最高人民法院关于审理侵犯商业秘密民事案件适用法律若干问题的规定》
第十七条 人民法院对于侵犯商业秘密行为判决停止侵害的民事责任时，停止侵害的时间一般应当持续到该商业秘密已为公众所知悉时为止。
依照前款规定判决停止侵害的时间明显不合理的，人民法院可以在依法保护权利人的商业秘密竞争优势的情况下，判决侵权人在一定期限或者范围内停止使用该商业秘密。
第二十三条 当事人主张依据生效刑事裁判认定的实际损失或者违法所得确定涉及同一侵犯商业秘密行为的民事案件赔偿数额的，人民法院应予支持。