杀菌剂防治植物病害的效果表现为保护作用、治疗作用和铲除作用。保护作用是在病菌侵染作物之前施药，保护作物免受病菌危害。许多杀菌剂如石硫合剂、波尔多液、代森锰锌、百菌清、五氯硝基苯等，都是以这种方式达到防治植物病害的目的。具有保护作用的杀菌剂，要求能在作物表面上形成有效的覆盖度，并有较强的黏着力和较长的持效期。治疗作用是在病菌已经侵染作物或发病后施药，抑制病菌生长或致病过程，使作物病害停止发展或使病株恢复健康。这类杀菌剂应具有良好的渗透性或内吸性，使药剂施用后能很快渗入植物体内发挥其防病和治疗作用，许多内吸性杀菌剂属于此类。铲除作用是病菌已在作物的某些部位（如种子表面）或作物生存的环境（如土壤）中存在，施药将病菌杀死，保护作物不受病菌侵染。此类杀菌剂多有强的渗透性，且杀菌力强，但持效期短，有的易产生药害，故很少直接施用于植物体。具有治疗作用和铲除作用的杀菌剂，要求施用后能较快地发挥作用，迅速控制病害的发展，并不要求有较长的持留期。
杀菌剂的治疗作用是指在病原菌已经侵染作物或作物发病后施药，抑制病原菌生长，使作物病害停止发展或使已发病作物植株恢复健康。这类杀菌剂应具有良好的渗透性或内吸性，使药剂施用后能很快进入植株体内发挥其防病、治疗作用。有些药剂虽然有一定的内吸治疗作用，在使用时常仍作为保护剂使用，即在病害侵染作物前施药。杀菌剂的铲除作用是指施用杀菌剂将已在作物的某部位（如种子表面）或作物生存环境中（如土壤）的病原菌杀死，保护作物不受病原菌侵染。这类杀菌剂多具有强渗透性、杀菌力强，但持效期短，有的易产生药害，故很少直接施用于植物体。
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