法律分析：用人单位应当依法及时办理社保登记，并足额缴纳社保费，否则将会面临各种法律风险。
但是根据员工个人要求以及公司实际成本考虑，公司可考虑如下操作方式：
(1) 由员工自行向公司出具申请不缴社保，并载明员工申请的原因、处理方式及不缴社保的相关责任由其自行承担，注明劳动者不得以此为理由解除劳动关系。
(2)如果公司通过补贴方式对员工进行补偿的，需要约定如果劳动者后期要求补缴社保，则之前所有支付的社保补贴应当予以返还。
在这种情况下，由于社保补贴的返还金额可能比较大，劳动者很有可能会因此放弃补缴社保。这种情况不会给予劳动者较大的经济压力，而且可以减少公司的损失。公司发放补贴时，也应单独列项向员工发放。
(3)公司可以给劳动者购买商业保险，以弥补劳动者发生意外可能要支付的医疗费用。
法律依据：《中华人民共和国劳动法》 第七十二条 用人单位和劳动者必须依法参加社会保险，缴纳社会保险费。
《中华人民共和国社会保险法》
第八十四条 对不办理社保登记的用人单位，社保机构有权责令限期改正，逾期不改正的，处应缴社会保险费数额一倍以上三倍以下的罚款；对其直接负责的主管人员和其他直接责任人员处五百元以上三千元以下的罚款。
第八十六条 对未足额缴纳社会保险费的用人单位，责令限期缴纳或者补足，并自欠缴之日起，按日加收万分之五的滞纳金；逾期仍不缴纳的，处欠缴数额一倍以上三倍以下的罚款。
第六十三条 用人单位逾期未缴纳或者补足社会保险费的，社保征收机构可以申请县级以上有关行政部门作出划拨社会保险费的决定，书面通知其开户银行或者其他金融机构划拨社会保险费；同时有权申请人民法院扣押、查封、拍卖其财产，以拍卖所得抵缴社会保险费。