深沪与非深户办理港澳通行证没有不同。
区别在于广东省与非广东省户口的区别在于签注类型。
【签注类型】
1、 个人旅游签注（G）发给赴香港或澳门进行个人旅游的申请人。该签注分为3个月一次签注、3个月二次签注、1年一次签注、1年二次签注、一年多次签注（限深圳户籍居民）五种，每次在香港或澳门停留时间不超过7天。
2、 团队旅游签注（L）发给参加
国家旅游局指定旅行社组织的团队赴香港或者澳门旅游的申请人。团队旅游签注分为3个月一次签注、3个月二次签注、1年一次签注、1年二次签注四种，每次在香港或者澳门停留不超过7天。
【申请材料】
1、个人旅游（G签）
（1）提交填写完整的《内地居民往来港澳地区申请表》1份（用钢笔或签字笔填写，不能使用
圆珠笔），提交大一寸（48mmX33mm）背景为蓝色的正面免冠光学光面彩色照片1张。(如首次申办或换发往来港澳通行证，须提交广东省出入境证件数码相片检测
回执)
（2）交验
身份证、户口簿原件（申请人未满16周岁，只需交验户口簿；军人只需交验身份证明），并提交复印件。
（3）持有有效往来港澳通行证的，提交往来港澳通行证。
（4）已向
公安部门通报出境备案的人员，申请办理《往来港澳通行证》及港澳个人旅游签注，须按干部管理权限提交单位意见。其他人员，无需提交单位或派出所意见。
2、团队旅游（L签）
（1）提交填写完整的《内地居民往来港澳地区申请表》1份（用钢笔或签字笔填写，不能使用圆珠笔），提交大一寸（48mmX33mm）背景为蓝色的正面免冠光学光面彩色照片1张。(如首次申办或换发往来港澳通行证，须提交广东省出入境证件数码相片检测回执)
（2）交验身份证、户口簿原件（申请人未满16周岁，只需交验户口簿；军人只需交验身份证明），并提交复印件。
（3）提交国家旅游局指定旅行社出具的全额旅游费用的发票复印件，交验原件；
（4）已向公安部门通报出境备案人员，申请办理《往来港澳通行证》及赴港澳团队旅游签注，须按干部管理权限提交单位意见。其他人员，无需提交单位或派出所意见。
（5）特别提示：申请人不得同时持有两本（含两本）以上有效往来港澳通行证，不得同时持有两个（含两个）以上同一前往地的有效签注。申请签注时须确保所持往来港澳通行证的有效期超过所申请的签注有效期20天以上。
办理时间和时限
【办理时间】周一至周六9：00—17：00（
法定节假日除外）。
【办理时限】首次申请往来港澳通行证及签注：15个工作日；再次申请签注：10个工作日。
非广东省办理
【办理条件】
（1） 目前只支持广州市和深圳市办理外省人员办理
（2） 属于深圳市/广州市各级政府聘用人员或国有、民营、中外合资、外资企业从业人员和个体工商业主;
（3） 持有长期有效(有效期为十年)的
《深圳市居住证》/《广州市居住证》，且持有时间已超过一年;
（4） 户籍地不在广东省，且户籍地属于按需申领护照地区。
（5） 年满16周岁。
【申请材料】
（1）填写完整的申请表（《内地居民往来港澳地区申请表》（非本市户籍人员填写《非本市户籍居民往来港澳地区申请表》）；并贴有申请人近期正面免冠蓝底彩色照片（48×33mm）的，并提交有效照片回执；
（2）申请人身份证明。内地居民交验
居民户口簿、居民身份证原件（申请人未满16周岁，只需交验居民户口簿；军人只需交验身份证明），并提交复印件。
（3）各签注类型所需其他材料，请参照具体往来港澳通行证签注类型（旅游、商务、探亲、逗留、其他事由）
办理时间和时限
【办理时间】周一至周六9：00—17：00（法定节假日除外）。
【办理时限】首次申请往来港澳通行证及签注：15个工作日；再次申请签注：10个工作日。