准噶尔盆地的层序地层学研究主要以侏罗系为主，且多以某一地区为对象。如蒲仁海等（1994）通过对露头、钻井、地震资料的综合研究，在准噶尔盆地东部侏罗系内部和顶底共识别出8个不整合面，并以此将侏罗系划分为7个层序。他们认为各层序均由低位体系域和高位体系域两个体系域组成，不整合面、沉积层序、体系域的形成均受构造升降—静止的多旋回运动所控制（蒲仁海等，1994）。张满郎等（2000）在准噶尔盆地阜东斜坡区进行了侏罗系层序地层研究，他们通过地震、钻井及生物地层资料的综合研究，认为该区侏罗系由2个构造层序组成，并可进一步划分为6个沉积层序。邓宏文等根据研究区的构造-沉积演化特征，用基准面旋回的方法将南缘中—新生代地层划分为5个长期基准面旋回和16个中期旋回（王红亮等，2000）。石油大学的鲍志东、管守锐等人通过地震、钻井和露头三位一体的研究方法，把准噶尔盆地侏罗系划分为2个超层序、7个层序和15个体系域（王宜林等，2001；鲍志东等，2002）。
图3-18 准噶尔盆地腹部侏罗系层序地层划分方案
侏罗系之外的其他层系的层序地层学工作则较少，一些人应用基准面旋回方法将准噶尔盆地东部的白家海—五彩湾地区的仓房沟群和小泉沟群划分为5个层序，并分析了各层序的体系域特征及沉积体系的分布（谢庆宾等，2003；冯兴强等，2003）。王龙樟（1995）根据野外露头、地震、钻井资料建立起准噶尔盆地中新生代相对湖水位升降曲线，并据此将准噶尔盆地中新生界的三叠系至第三系划分为5个层序。
2004～2005年中石化西部指挥部领导的联合攻关项目“准中项目”在层序地层研究方面取得了更深入、更符合生产实践的新认识与新成果。
基于关键界面的识别，综合吸收前人的研究成果，充分应用现有的资料，初步确定了准噶尔盆地腹部的层序地层划分方案（图3-18）。
8口单井层序地层分析表明：准噶尔盆地腹部侏罗系可划分出12个三级层序，其中：八道湾组（J1b）3个，三工河组（J1s）3个，西山窑组（J2x）2个和头屯河组（J2t）2个，齐古组（J3q）和喀拉扎组（J3k）各1个，分别命名为SQ1、SQ2……SQ12；腹部大都缺失SQ11、SQ12两个层序。识别出13条层序界面，分别命名为J1b-SB1（侏罗系八道湾组三段底部的层序界面）、J1b-SB2……K1-SB13。每一个三级层序均具完整的三分结构：低位体系域（LST）、湖进体系域（TST）和高位体系域（HST），而在浅水沉积背景区的夏盐3井等缺失LST，因此必须注意浪蚀底形、斜坡底形及盆地底形这种沉积背景。每个三级层序平均年限约5ma，厚度变化较大。至此，初步建立了侏罗系层序地层划分方案。