农村合作医疗报销的常见方式有两种：
在医疗机构支付医疗费用时直接报销结算；
携带医疗费用发票、医疗费用清单、住院小结等资料前往当地农村合作医疗社办理报销手续。
不同地区的农村合作医疗报销比例有所差异。以长沙为例，以下是具体的报销规定：
门诊报销：
村卫生室可报销70%，个人自负30%；
乡镇卫生院、社区卫生服务中心可报销60%，个人自负40%；
院校医院或医务室可报销70%，参保大中专学生、以学校为单位整体参保的普通学生个人自负30%。
一个结算年度内最高支付限额为800元。
住院医疗费用报销：
乡镇卫生院、社区卫生服务机构，起付线200，可报销85%；
三类收费标准医疗机构，起付线300，可报销70%；
二类收费标准医疗机构，起付线500，可报销65%；
市级一类收费标准医疗机构，起付线1100，可报销60%。
一个结算年度内，累计最高限额为15万。
生育报销：
平产最高补助1300；
剖宫产最高补助1600；
孕产妇因为高危重症救治所发生的医保范围内住院医疗费用，可按照疾病住院标准进行报销。
大病医疗：
普通群众起付标准为22324：
0至3万部分可报销60%；
3万至8万部分可报销65%；
8万至15万部分可报销75%；
15万以上部分可报销85%；
年度限额为40万。
困难群众起付标准为11165：
0至3万部分可报销65%；
3万至8万部分可报销70%；
8万至15万部分可报销80%；
15万以上部分可报销90%；
无限额。