法律分析：1、含义上：公司是依照公司法在中国境内设立的是以营利为目的的企业法人。是适应市场经济社会化大生产的需要而形成的一种企业组织形式。工厂是一类用以生产货物的大型工业建筑物，现代对工厂也称为“制造厂”、“生产企业”。
2、管理上：公司特别是股份有限公司可以公开发行股票、债券，在社会上广泛集资，便于兴办大型企业；公司实行彻底的所有权与经营权分离的原则；公司特有的组织结构形式使公司的资本、经营运作趋于利益最大化，更好地实现投资者的目的；公司形态完全脱离个人色彩，是资本的永久性联合。工厂的生产过程对管理技术的需求非常高，使很多管理理论产生出来。一般而言，工厂管理涉及将低、中、高技术工人以及主管、经理等人士作分级管理，以人为本的核心。
3、经营类型上：公司是根据《中华人民共和国公司法》而设置的企业类型公司。公司是国际流行的商业组织形式，我国法律认可的公司形式有有限责任公司和股份有限公司。工厂属于生产型企业，不属于我国法律认可的企业类型中。
法律依据：《中华人民共和国公司法》
第二十三条 设立有限责任公司，应当具备下列条件：（一）股东符合法定人数； （二）有符合公司章程规定的全体股东认缴的出资额； （三）股东共同制定公司章程； （四）有公司名称，建立符合有限责任公司要求的组织机构； （五）有公司住所。
第二十四条 有限责任公司由五十个以下股东出资设立。