一登上王位的秦惠王赢驷就处决了商鞅，还有一个主要的原因是商鞅已成为王权与贵族利益冲突的焦点。贵族们不敢对王权发出不满，但要把这种不满发泄在商鞅身上，所以秦惠文王刚刚即位，商鞅就被诬告谋反，为了处理好王权和贵族的关系，秦惠王赢驷不得不让商鞅死，以此安抚阶级的情绪。商鞅变法一开始就引起大量秦国老贵族的利益，只是迫于秦孝公没有发作而已。秦孝公一死，贵族纷纷把矛头指向商鞅，新君秦惠王为了稳定时局必杀商鞅以平息贵族之愤。
私人恩怨
当年赢驷年少时犯法被商鞅新法处置，作为尊贵的王室成员，因为自己的一个不小心触犯了法规，商鞅居然刑其大夫，黥其师，不但自己受到处罚，赢驷的两个师傅也被判刑。所以秦惠王，包括公子虔怀恨在心是有可能的，但是赢驷也并不是一个彻底无情无义的君主，到底还是一个务实的君王，处决商鞅以后，其变法的内容仍在执行。
斩草除根
在法治建设完成后，秦惠文王和商鞅拥有巨大的权力，既是法治的最强维护者，也是法治的最大危害者，而君主制下的法的象征只能是一个人，商鞅这样的能人只能在秦国为秦多用，放在别国都是个极大的威胁。君主制时代臣子势力，威望盖过君主是很可怕的，当时商鞅即是如此。从庙堂到地方到处都是被商鞅提拔的拥护变法的官吏，甚至是军队也不乏大量商鞅的支持者。尽管商鞅是大公无私，忠君爱国，但是这样强大的力量对于新即位，根基不稳的秦惠王来说是非常可怕的。同时，商鞅变法已全面实施，改革也走上了正轨。因此商鞅之死是无法避免的悲剧。
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