区别很大的~
如果想在微电子做设计等技术相关的工作，是强烈建议读研的。这个专业与工程应用关系十分紧密，对技术实践能力的要求很高。实际上，本科阶段学到的都是基础理论，与实际应用的技术相去甚远，所以本科生只有少数同学能进入设计岗位，大部分从事于专业相关的技术支持、售后、销售等工作。而硕士毕业后，几乎全部的同学都去了设计岗位。待遇也有一定的差距。
以好点的学校为例，本科生毕业去的企业有中芯国际、飞思卡尔、三星电子、华为、几个做网络设备的公司、中国移动、中国联通等等，这些是去向相对较好的，还有一大部分同学去了一些小公司小企业，总体上说，基本上没有做设计的，大部分是销售、售后等。待遇大致在2500~5500之间，3500~4000的居多。
而硕士就业的企业有华为、Intel、AMD、大唐、联发科、威盛、中兴、华大、航天科工集团以及中电集团下属的各大研究所等。基本上都是设计岗位，待遇4000~9000之间（部分国企表面薪酬偏低）。
当然并不是入职薪酬就能说明一切的，本科还是硕士对将来的发展方向起到很大作用，当然也看你个人的能力和机遇。
就业与你的毕业院校关系很大，如果楼主本科院校不是很好，建议读研去个好点的学校，至少是985，这样才能保证你的就业。
有问题再补充。
参考资料：无