办理检疫合格证的流程包括申请、检测和办证三个步骤。首先，前往当地动物卫生监督所申请，然后到指定兽医机构进行检测，并支付相应费用。最后，凭兽医部门出具的检测报告前往当地动物卫生监督所办理证件。
检疫合格证的办理流程：先去当地的动物卫生监督所申请，然后到当地动物卫生监督所指定兽医机构进行检测，并交纳检测费用。然后持兽医部门出具的检测报告到当地的动物卫生监督所申请办证。
办理动物检疫合格证明的方法：
1、 办理流程。办理《动物检疫合格证明》需现场填写《检疫申报单》，携带相关材料，并将犬、猫带到办理现场进行临床检查。
2、 需要注意的是。请在现场办理《动物检疫合格证明》前，提前3天预约办理。
3、 需在犬、猫注射狂犬病疫苗21天后办理《动物检疫合格证明》。
4、 办理《动物检疫合格证明》需要提交哪些材料。如果爱宠是本市犬。
5、 饲养者的有效身份证明。
6、 公安部门核发登记在闵行区内，并在有效期内的《养犬登记证》兽医主管部门发放的有效期内的《狂犬免疫证明》。
7、 犬只出生满3个月的，饲养者应当按照《上海市养犬管理条例》的规定，将犬只送至兽医主管部门指定地点，植入电子芯片。
8、 不满3个月的犬只，必须提供母犬《狂犬免疫证明》和《养犬登记证》。
9、 明确告知运载方式，提供运载工具牌号。
综上所述，申请上海动物检疫合格证明的流程相对简单。首先，您需要准备相关材料，包括动物的健康证明、疫苗接种记录等。然后，您可以前往上海市动物检疫部门，填写申请表并提交所需材料。接下来，您需要缴纳相应的费用，并等待审核。一般情况下，审核时间不会太长。如果您的材料符合要求，您将获得上海动物检疫合格证明。请注意，申请人需要确保动物符合相关检疫要求，如疫苗接种、健康状况等。此外，不同种类的动物可能有不同的申请要求，请在申请前仔细阅读相关规定。
【法律依据】：
《中华人民共和国动物防疫法》
第五十三条
省、自治区、直辖市人民政府确定并公布道路运输的动物进入本行政区域的指定通道，设置引导标志。跨省、自治区、直辖市通过道路运输动物的，应当经省、自治区、直辖市人民政府设立的指定通道入省境或者过省境。
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