菏泽有菏泽医学专科学校、菏泽家政职业学院、菏泽职业学院等3所专科学校。
1、菏泽医学专科学校
菏泽医学专科学校（Heze Medical College）位于中国牡丹之都——山东省菏泽市，是一所由山东省人民政府举办的省属公办全日制普通高等专科学校。
菏泽医学专科学校的前身是1950年经国务院批准建立的平原省卫生学校；1958年，更名为菏泽地区医厅段学专科学校，后又历经山东省菏泽地区卫生学校、山东省菏泽地区医学专科学校、山东省菏泽地区卫生学校等办学时期；1978年经国务院批准，更名为菏泽医学专科学校。
2、菏泽家政职业学院
菏泽家政职业学院（HZ Domestic Professional College）是经山东省人民政府批准设立、教育部备案的以家政为特色的全日制公办高等职业院校。
学校前身是成立于1958年的山东省菏泽卫生学校；2007年3月，经山东省人民竖昌政府批准、教育部备案，建立了菏泽家政职业学院。
据2023年4月学校官网显示，学校占地744亩，建筑面积10余万平方米；设有9个教学单位、6个教辅单位，开设26个大专专业和13个中专专业；有教职工487人，全日制在校生近15000人。
3、菏泽职业学院
菏泽职业学院（Heze Vocational College）坐落于山东省菏泽市，是经山东省人民政府批准、国家教育部备案的国办全日制普通高等学校，先后被命名为全国智能制造领域中外人文交流人才培养基地、全国退役士兵职业技能培训基地、中国牡丹产业人才培训基地。
山东省外包服务培训基地、山东省跨境电扮纤誉商培训基地、山东省旅游产学研合作基地、山东省华文教育基地、山东省中华文化传承基地、山东省百佳学生资助工作单位。
学校始建于1963年，时名菏泽供销学校；2012年12月12日，省政府批准菏泽职业学院在整合山东菏泽信息工程学校、菏泽工业学校、菏泽财经学校三校资源上正式建院。