1、按问题所述，既然有相应的协议约定，则可以根据该协议约定内容办理过户手续。 2、在A在过世之前，可以起诉要求其履行协议约定配合办理过户，但现在A已去世，则起诉履行协议已不具备条件。 3、不过，现在可以仍然根据该协议，起诉A的法定继承人，以“确权”为案由提起诉讼，确认该套房屋归B实际所有。 4、鉴于案件所述时间已较长，建议应尽快诉诸法律途径处理。
《中华人民共和国民法典》第一千零七十六条 夫妻双方自愿离婚的，应当签订书面离婚协议，并亲自到婚姻登记机关申请离婚登记。 离婚协议应当载明双方自愿离婚的意思表示和对子女抚养、财产以及债务处理等事项协商一致的意见。 《中华人民共和国民法典》第一千零八十七条 离婚时，夫妻的共同财产由双方协议处理；协议不成的，由人民法院根据财产的具体情况，按照照顾子女、女方和无过错方权益的原则判决。 对夫或者妻在家庭土地承包经营中享有的权益等，应当依法予以保护。