一、首先要求体系文件本身的正确，满足标准要求，通俗易懂，易于理解，适合于船员的阅读、理解。只有具体运行船舶体系的船员理解了、接受了，才能在实际工作中运用、操作。如果广大船员没有理解、接受，还谈什么的可操作性、适合性？
二、提高船员文化素质，也是提高船舶体系运行质量的重要环节。随着船舶设施设备的更新，航运技术的提升等，体系运行中涉及这些方面的技术含量逐步提高。船员文化素质如不能跟上或适应发展的要求，势必影响到体系运行的质量。同时，从企业宏观上看，作为当今船舶的高级船员，光有驾船的技术是不够的，还应参与到企业的经济和安全管理中，提升企业的整体管理水平，文化素质也是必不可少的。
三、平时公司和船舶加强对船员体系知识的培训，使船员完全熟悉体系。只有所有船员熟悉了，而不是某一、两个人知道，才能使体系得到有效落实、运行。体系的运行不是某个人或某个部门的事，应该众所周知、广而训之。公司和船舶必须注重对船员体系知识的持续培训和更新。
四、公司和船舶各级领导提高认识，高度重视，狠抓落实。部份公司体系运行存在“两张皮”的现象（体系文件规定与实际操作相差甚远），之所以出现这样现象，一方面认为体系作用不大，可有可无；另一方面认为体系运行起来挺麻烦，不愿意按体系文件要求去做。归根结底就是思想上认识不够，不能正确认识体系运行的意义所在，还不明白体系运行的重要性和对安全工作的指导意义。所以要求各层领导提高认识，高度重视是关键。只有公司和船舶领导重视了，船员才会跟着重视，才会去学习体系文件，并在实际工作中去运用、落实，才能克服“两张皮”的现象。
五、不断开展管理复查，及时对体系文件进行修正、更新。体系运行的环境和条件在不断发生变化，这些变化包括法规的变化、船舶设施设备的变化、通航条件的变化等等。体系文件也不能一成不变。为了保持体系的可操作性、适合性，船公司必须定期或不定期在公司范围内（船舶在全船范围内）开展管理复查，以便对与实际操作不适合的体系文件规定及时修改或更新，从而提高体系的运行质量。
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