因为李显曾试图忤逆她。身为武则天第三子的李显是在他两位兄长先后猝死以及被废之后才继立为太子的，而这一时期的武则天已是手握重权。待李显登基之后，武则天虽不是皇帝却又胜似皇帝，朝中大小事宜均经她之口进行裁决。
李显虽是武则天的儿子，但是他同样也是一国之君，是以他对武则天擅政一事很是不满。但是作为根基尚浅的新帝，他手中的权势根本没法与武则天相抗衡的。是以他决定对韦皇后亲族给予重用，借此扶植自己的势力。为了达成这一目的，李显意欲将自己岳父韦玄贞提拔为丞相。奉高宗遗诏担任辅政重任的裴炎却对此进行了阻止，且他还将李显所说的“我以天下给韦玄贞也无不可”这一句话告诉了武则天。
久居高位的武则天在得知这件事情之后自然非常生气，她无法容忍李显试图忤逆的行为。为此在不久之后李显便失去了帝位，而此时距离他登基尚不足两个月。除了剥夺李显的帝位之外，武则天还将他流放到了均州并幽禁了起来。与此同时，武则天又将另一儿子李旦立为皇帝，而她自己则继续临朝称制。因为有李显这个前车之鉴，所以李旦在登基之后表现得十分老实，在位期间从未试图反抗过武则天。
遭到流放的李显一共被幽禁了十四年之久，而在这十四年里武则天如愿登上了皇位。而在十四年之后武则天之所以会将李显放出，实际上也是基于自身利益的考量。李显重获自由的契机是立储一事，武则天觉得立自己儿子为储君更有利于维护她的身后尊荣。不管是将李显流放，还是将李显复立为储君，其实都可以看出武则天对于权势的重视要远远超过母子亲情。
李显多年提心吊胆，晚上睡觉不久经常被噩梦惊醒，听到皇帝的使节来了，吓得尿裤子了。《旧唐书》“每当敕使到达时，辄不敢自杀，武则天知道后大为生气，将李显直废，降为庐陵王，让李旦即位为皇帝，在武则天心中，李显想反抗，控制不了多少，毕竟武则天要当皇帝，身边有这样的人，麻烦不少。
所以，李显被废后，武则天将他贬为均州，十四年来，李显都很害怕，虽然自己还是王，但大家都知道，这位王爷的生命不过是武则天的一句话，但是，李显终还是熬过去了，被软禁十几年后，他被接回去，重新做了太子，武则天后期，张建之等人发动政变，找回了李唐神器， 一个是维持朝政多年的太后，一个是登上皇位的天真皇帝，谁能赢？
晚年的武则天经过深思熟虑，终于决定将皇位传给儿子，武则天的两个儿子中，老三李显已经流亡十多年，老四李老爷接替皇室居住在东宫，与太子只有很小的距离，因此，很多人认为武则天力挽狂澜，任命李旦为太子，李显毕竟是李旦的哥哥，应该按照“长子继位”的原则被任命为太子，但是，所谓的“长子继承制”只是任命李显为太子的次要因素。
如果武则天真的重视传统礼仪，她就不会成为中国古代历史上最有名的女皇帝，但是，李显以为终于登上了皇位，被尊为天子，原本的戒心也开始放松。 在一些具体法令上，唐中宗和武则天出现了分歧，其中，最重要的是，李显有意重用继父，而武则天则鄙视岳母，武则天决定立儿子为太子，这不意味着她会下台，在她的生命结束之前，武则天还必须想办法防止太子威胁她的皇权。
