宅基地确权的基本原则是“一户一宅”，按你所描述的情况“两户一宅”，是否能申请宅基地呢？答案是肯定的。即能够在村集体组织里可以申请宅基地。
申请宅基地的条件和申请流程，可能因地域不同而有所不同。我是地地道道的农村人，同时，像村民申请宅基地等这样的具体事情，本片区的都是经我手签字盖章的，因此，我来说一说具体怎么样操作吧。（以我们家乡为例，全国各地的操作流程应当差异不大，大同小异吧）
首先，你们目前是两户一宅，需要申请宅基地，那么先得“分户”，只有“一分为二”，才能在集体组织里获得宅基地。分户的条件是，带着你的户口本，身份证和结婚证，以及分家协议，由村（居）委会开好证明，再去乡（镇）派出所（户口管理办）办理正式户口，成为正式的“一户”。如果具备这些条件，分户很容易，一个工作日内即可办理完毕。
其次，有了正式的户口本了，则可以向村（居）委会写申请，获取宅基地了。这个宅基地的选择，需要自己有闲置的土地，如果有空闲地最好，没有空闲地，则要事先与亲邻兑换好，如果需要占用农用地，必须是“一般”农田，“基本农田”里是不允许修建房屋的。
另外，在村（居）委会的申请审批告知书公示的七天内，没有反对和投诉的异议及意见。村（居）委会会及时通知你拿正式申请表，在你所在的村组，进行户户签字，组长（片长）签字并盖上公章，然后再到村（居）委会签字盖章，由村（居）委会将此申请表送交乡镇土地管理部门。
最后，乡镇土地管理部门将协同村（居）委会进行实地堪察并现场勾图，标注“四至”（东西南北的界限），就算大功告成。正式的建房用地审批表则由县级国土管理局盖好章后由乡镇土地管理部门择日下发到建房者。
总结：一般情况下，只要乡镇土地管理部门勾图后，就可以正式动工兴建了。现实情况就是这样，只要符合政策，符合条件，宅基地的申请并不难。此情此景，希望能为你提供参考。