中药按毒性分类最早见于《神农本草经》。
我国最早的本草学专著《神农本草经》按毒性和功能将365种药物分为三类。上品“无毒”，中品“有毒或无毒”，下品“多毒”。
《神农本草经》还明确提出了配伍禁忌和配伍减毒思想，云：“勿用相恶相反者。若有毒宜制，可用相畏相杀者。”并提出服用毒药时应遵循的剂量原则，云：“若用毒药疗病，先起如黍粟，不去倍之，不去十之，取去为度。”
学术价值
《神农本草经》的历史地位不可低估，它将东汉以前零散的药学知识进行了系统总结，其中包含了许多具有科学价值的内容，被历代医家所珍视。而且其作为药物学著作的编撰体例也被长期沿用，作为中国第一部药物学专著，影响是极为深远的。《本经》首次提出了“君臣佐使”的方剂理论，一直被后世方剂学所沿用，有序例（或序录）自成一卷，是全书的总论，归纳了13条药学理论。
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