一、完成父亲遗愿
中国大一统的王朝大都是由北至南而成，明太祖朱元璋发迹于南方，由南向北打下天下，这在中国历史上算是比较少见的成功案例。虽然成功打下基业，定都南京，但是朱元璋其实很清楚，南京并非是定都的最佳选择。
在洪武二十四年，也就是1391年，朱元璋还派出他的大儿子，也就是太子朱标前往关中和洛阳两大古都进行考察。目的就是准备将国都迁往西安或者洛阳。不过可惜的是朱标在考察完回到南京以后没多久就生了大病，1392年，刚刚37岁的朱标就病死了。
朱标可是朱元璋最喜欢的儿子，朱元璋对他寄予厚望的，在他身上花了很多心血，本来希望他成为一代名君的，结果却先走了。老朱很伤心，迁都的事再也没心情去想了。他曾在《祀灶文》中提到过迁都的事，说“本欲迁都，今朕年老，精力已倦，又天下初定，不欲劳民……” 。6年后，朱元璋也带着遗憾走了。
朱棣登上皇位后迁都，或许有完成父亲遗愿的成分在里面，不过却没有迁到洛阳或西安，而是迁到了北京。
二、天子守国门
明初，对大明王朝最大的威胁还是逃亡漠北的元朝残余势力，当初被封为燕王的朱棣在北元的较量中，对形势是很清楚的。登基之后的朱棣开创天子守国门的先例，是有非常积极的意义的。朱棣一生好攻伐，从后来的几次御驾亲征漠北就能看出来，他是不甘做一位只知道享乐的皇帝的，是个有理想、有抱负、有作为、有担当的皇帝。
三、巩固皇位
大家都知道朱棣上位并不是太光彩，虽然他打着“遵奉祖制”的旗号发动靖难之役，这只不过是他出兵的一个幌子而已，并不足以让所有人都信服。他的侄子小皇帝朱允炆不知所踪就说明，南京是有一批忠于旧主的势力，只不过暂时隐藏起来而已。这对刚篡位的朱棣来说，并不是件好事，因为南京旧有的各种势力盘根错节、根深蒂固，而他的根基在北京，要在南京扶持自己的亲信，也不是一朝一夕的事，所以从不论是从个人安全方面考虑，还是从皇位的巩固上来看，迁都都是最佳的选择。
另外，为防卫边疆，朱元璋在北方封有好几位手握重兵的藩王，从那位被朱棣绑架夺了朵颜三卫的宁王朱权的实力来看，其他几位镇守北部边疆的藩王实力均不弱。为了有效控制这些藩王，避免再出现第二个朱棣，迁都至老根据地北京是朱棣不二之选。
四、北京地理位置比南京更有优势
首先可以肯定的是朱棣和朱元璋一样，都有大才。朱元璋能看出南京“惟宫城前昂后洼，形势不称”，朱棣不会看不出。如果非要在南方选择一地作为国都，有长江作为主要屏障，四周也有些小山的南京是不错的选择，但是从地缘优势来看，南京相比北方的洛阳、长安、北京来说还是要差一些的。
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