从法定权利他们没有这样的权利，且涉嫌侵权了。
但在实际生活中往往用人单位对违约的一方都用这样的方式卡着一个人的人事关系和档案。明知他们作的过份，但实际上对方有若干的理由对付你，所以获得
胜算的可能性很少。唯好的办法就是找到能管住它的机关出面纠正，让他们放档。
公办学校属于事业单位，编制内员工与事业单位的劳动合同签订有其特殊规定，不受
劳动合同法规定约束，学校可以无条件地在劳动合同中约定违约金，但数额不宜过高（1万元应为合理）。至于学校没有将其中一份合同交付给你的做法是不合法的，但是你必须举证证明学校采用这种做法，这对于你来说举证是比较困难的，因此该合同的效力应该是没有问题的。关于教育局是否有权扣档案的问题，关键看你们之间的劳动合同如何约定，如果没有明确约定，教育局是无权这么做的，如果强行扣留，你可以申请行政复议或者提起
行政诉讼。