1、车被运管所扣了罚款一万，问题的关键在于你是否是合法营运，如果是非法的：非法营运是指没有依法取得营运权而实施了营运行为。即未按规定领取有关主管部门核发的营运证件和超越核定范围进行经营。
2、《中华人民共和国道路运输条例》第六十四条规定，未取得道路运输经营许可，擅自从事道路运输的，由县级以上道路运输管理机构责令停止经营；有违法所得的，没收违法所得，处以违法所得2倍以上10倍以下的罚款；没有违法所得或违法所得不足2万元的，处以3万元以上lO万元以下的罚款。
3、一般来说是不会有负刑事责任，但是申请法院强制执行的话，还是有一定的麻烦，比如查扣正常合法资产，然后低价变卖以缴纳这笔罚款另外，时间越长，滞纳金越高。基本上是财产上的损失。
4、非法营运被扣留，需要缴纳罚款，情节严重的可以执行强制过户拍卖，部分地区，扣留黑车60天以后，无人处理就会执行，具体期限要以当地执法部门来定，没有明确的规定。《关于无证经营查处取缔办法》（以下简称《办法》）完全适用于当前的非法营运无照经营的问题，并具体指出，“未依法取得许可证、批准文件和营业执照擅自从事客运经营活动——私家车营运、套牌车营运、外地车跨地区营运，均属于非法经营行为”。
如果是非法经营，就去交了钱，如果是合法经营，拿出证据证明。当然你对罚款的金额有异议，可以申请行政复议或行政诉讼，罚款达3000元，可以要求开听证会。
中华人民共和国道路运输条例第六十四条：
违反本条例的规定，未取得道路运输经营许可，擅自从事道路运输经营的，由县级以上道路运输管理机构责令停止经营；
有违法所得的，没收违法所得，处违法所得2倍以上10倍以下的罚款；
没有违法所得或者违法所得不足2万元的，处3万元以上10万元以下的罚款；
构成犯罪的，依法追究刑事责任。
《中华人民共和国道路运输条例》第六十四条规定，未取得道路运输经营许可，擅自从事道路运输的，由县级以上道路运输管理机构责令停止经营；有违法所得的，没收违法所得，处以违法所得2倍以上10倍以下的罚款；没有违法所得或违法所得不足2万元的，处以3万元以上10万元以下的罚款。
《中华人民共和国道路运输条例》第六十四条规定的处罚，既规定了按违法所得倍数处罚，又规定了按绝对数额进行罚款两种处罚方式。具体理解如下：
第一层次是未取得道路运输经营许可，擅自从事道路运输经营，其违法所得在2万元以上的违法行为。对这种违法行为，应当由县级以上道路运输管理机构责令停止经营，没收违法所得，处违法所得2倍以上10倍以下的罚款。（也就是最少罚4万）
运管所全称是道路运输管理所。通常指县一级设立的道路运输市场管理部门。工作职责主要是贯彻执行国家有关道路运输的方针、政策和法规，并具体实施；按照管理权限，对道路运输行业进行行政许可，并对道路运输管理行业实施行业管理，维护运输行业安全和市场秩序；监管道路客货运输、运输站场、汽车维修以及运输服务；负责道路运输行政执法工作 。