导致巧克力囊肿的原因有以下四点：
1、人工流产：很多女性都有多次人工流产的经历，这样就会使得女性的子宫内膜受到很大的伤害，引起子宫内膜异位，最终引发巧克力囊肿。
2、性生活缺少规划，这也是导致女性出现卵巢囊肿的重要原因之一。这种疾病大多和体内雌激素分泌过高，经常在经期进行性生活，导致经血逆流。
3、外界环境因素也是导致女性出现卵巢囊肿的重要原因之一，由于现在工作和生活的双重压力，导致女性的精神压力过大，神经性功能紊乱，影响女性的内分泌，以致卵巢功能衰退。
4、其他疾病导致：盆腔炎症的患者，常会出现盆腔粘连的症状，如果不及时治疗的话，就会导致大量的陈旧积血淤积，引起巧克力囊肿的发生。
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