药山即“药用植物盛产之山”，因盛产中草药材而得名，药山位于巧家县城东北约70公里的荞麦地镇。金沙江环流于东北，牛栏江萦绕于东南，主峰轿顶山海拔4041．6米，山势巍峨，终年积雪，雄居于滇东北群峰之上。是进入长江中下游的最后一座高山。药山海拔高差3524．6米。
药山是一座中草药材的博物馆。药山立体气候显著，受暖湿气流的影响，雨水多、植被厚。气候的多样性，决定了物种的多样性，加之药山地理位置偏僻，药山成了滇东北动植物的避难所。迄止晚清，药山仍然被以乌蒙冷杉为主的针叶林和以高山栎为主的常绿阔叶林构成的原始森林覆盖。天然林郁闭度高，为野生药材、珍稀动植物的生长和生息繁衍创造了条件。
据调查，药山有高等植物1400多种，有国家级重点保护植物五针松、红豆杉、珙桐、攀枝花苏铁、篦子三尖杉、连香树、水青树、西康木兰等等，保护植物总数达52种，国家级重点保护动物有金钱豹、黑熊、猕猴、林麝、斑羚、红腹角雉、白腹锦鸡、白肩雕、雕鹗、金雕、乌雕等29种。药山的药用植物种类总数达856多种。还有杜鹃、报春、百合、二月花等多种观赏花卉植物，资源极其丰富。在约3000米的高山草甸沼泽的湿地上，还有黑颈鹤和灰鹤等重要越冬水禽。
药山史学上称为木雅洛宜山，经过彝族史学的专家多年研究，认为药山就是彝族六祖分支的发祥地。史说中“彝族再生始祖慕居蜀地，适缝天下洪水泛滥，笃慕便带领他的部落向今云、贵、川三省乌蒙山转移，躲避洪水。洪水退后，笃慕主持祭祀，由他的六个儿子分别率领部落的6个支系向不同的方向发展，史称六祖分支”。药山因此成为彝族人民心中的“圣山”，是整个彝族生存的生命砥石。今天，大药山下居住着汉、彝、苗、回、布依等多种民族，药山对他们，不是神话和传说，而是赖以生存的生命之山。
为了让外界了解药山，让药山走向世界，巧家县加大了对药山的保护管理，进一步提高药山及其周边的森林植被覆盖率，改善动植物的栖息环境。
2009年1月28日省级自然保护区评审委员会主持召开了药山自然保护区晋升国家级自然保护区申报论证会。药山自然保护区以全票通过省级论证。7月11日药山自然保护区通过了国家林业局的评审。
药山自然保护区海拔517~4041.6米，是川滇黔交界地区生物多样性最为丰富，保存最为完好，植被水平地带性尚存，垂直带谱基本完整的高大山体，生存有堪称植物界“大熊猫”的巧家五针松。经专家考察，药山有高等植物1400多种，有红豆杉、洪桐、攀枝花苏铁、等52种国家重点保护植物；陆生脊椎动物262种，有金钱豹、云豹、林麝、黑熊、猕猴等国家一级、二级保护动物31种；各类药用植物种类达到850多种。国务院已批准药山自然保护区升格为国家级自然保护区。
