云南白药的配方和制法从不外传，1955年缪兰瑛将配方献给中华人民共和国中央人民政府，之后一直在中华人民共和国卫生部绝密为其保存。此后一些书籍和杂志上出现过关于云南白药的配方和制法，但生产者声称“均不正确”。关于云南白药的原植物考证与鉴定及其化学成分的分离和结构鉴定一直引起各国科学家的关注，也用过各种现代分析方法进行过解析。用发射分光计分析出云南白药中有钙、磷元素存在。用光谱分析时，未见紫外吸收；红外吸收光谱呈现出与葛根淀粉相近的图谱，可推断为同一物，在用薄层色谱点样分析后也得到相同结论，由此推断云南白药可能是用葛根淀粉做赋形剂。用超临界流体色谱法测定出云南白药中含有人参二醇、人参三醇等物质。
2010年12月，网友在论坛和微博上指出，云南白药部分在国内是“保密配方”的产品在美国却被打上了配方。在美国市场上销售的云南白药产品成分表中，详细罗列了所谓的“保密配方”。
美国配方 每盒服用次数48次含量0.5g总成分500mg散瘀草85mg苦良姜30mg老鹳草36mg白牛胆25mg田七200mg穿山龙57.5mg淮山药66.5mg
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