潭柘寺历史上不同时期属于不同的宗派，主要是禅宗和律宗。
潭柘寺始建于西晋永嘉元年（公元307年），是佛教进入北京地区后所修建最早的一座寺院，当时规模不大，名叫嘉福寺。
唐代武则天万岁通天年间（696-697年），佛教华严宗高僧华严和尚居住在幽州城北，“持《华严经》以为净业”，“其所诵时，一城皆闻之，如在庭庑之下”。在幽州都督张仁愿的赞助下，华严和尚来到了潭柘山开山建寺，购买了嘉福寺附近西坡姜家和东沟刘家的土地，以破败了的嘉福寺为中心，重建寺庙。因华严和尚属于华严宗，故而潭柘寺就成为了幽州地区第一座确定了宗派的寺院，同时也是华严宗在幽州地区的第一座寺院。
唐代会昌年间，唐武宗李炎崇信道教，在道士赵归真和权臣李德裕的怂恿下，唐武宗下令在全国排毁佛教。潭柘寺也因此而再次荒废。直到了五代后唐时期，著名的禅宗高僧从实禅师来到了潭柘寺，铲除荒夷，整修寺院，“师与其徒千人讲法，潭柘宗风大振”，才使潭柘寺重又繁盛了起来。当时的潭柘寺也从此由华严宗改为禅宗。在金代，禅宗在中都（今北京）地区有了很大的发展，潭柘寺先后出现了数位禅宗大师，大大提高了寺院的声誉。元代的潭柘寺依然辉煌，元世祖忽必烈的女儿妙严公主曾在潭柘寺出家。当时著名的僧人有瑞云霭禅师、柏山智公禅师等，都是当时禅宗佛学大师，享有崇高的声望。
清代是潭柘寺历史上最辉煌的时期。在清代，潭柘寺改禅宗为律宗，并出现了多位律宗大师，如：震寰律师，止安超越律师，了然行修律师等。
1950年，北京市园林局接管了潭柘寺，稍加整修后，作为名胜古迹景区向游人开放，成为北京市首批开放的七个公园景区之一。 1997年初，潭柘寺恢复宗教活动。
参见官方网址：
http://www.tanzhesi.com.cn/index.asp