主要交通工具有下面七种方式。它们的利弊很明显，就是价格方面，飞机往往是最贵的，公交车最便宜，但是时间成本也要算上，新干线是性价比最高的了，具体要如何选择，还要看自己的需要。
1.航空
到日本最方便的就是飞机。
日本的主要国际机场是成田和关西机场。从这两个机场出发，有许多便捷的飞往日本各个城市的航班。
2.铁路
日本的铁路和铁路总长度为47,000公里。铁路新干线是长途客运主要出行方式，也是向外国游客推荐的主要交通工具。
它被称为“理想超级快车”，包括东京至大阪的东海路新干线、大阪至博多的山阳新线、大公至生高的新干线、大公至新泻湖的新干线、福岛至山的新干线等。此外，在日本各大城市，地铁无处不在，比汽车更快捷、及时、方便。
短途旅客列车票可在各车站售票机购买。短途客票可在各车站售票机购买，长途火车票可在车站“绿色窗口”购买。
3.水运
日本的几家航运公司提供定期航班，从日本的主要港口到亚洲附近各国的港口。特别是从日本的福冈到韩国，有渡船和高速船在航行。
4.公交车
在日本，无论白天还是夜晚，城市之间都有很多长途巴士出行，票价比飞机和火车便宜。建议旅游者选择更方便的旅行时间。
在市内，将有不同汽车公司运营的定时汽车线路。每家公司的票价都不一样，但在城市里行驶的公共汽车的票价一般在200日元左右。
5.电车
日本有轨电车套餐适用于经过日本铁路的所有线路，在有效期内可无限制地使用。套票分为绿色(37800日元/7天)和普通(28300≤7天)。持有绿色优惠券的人在乘坐的时候无需额外付费。
6.出租车
日本城市有大量的出租车，各个车站和机场的出租车专用车站是最方便的交通工具之一。
当日本车辆靠左侧行驶时，乘客必须从车辆左侧的后门上下移动，司机会主动为乘客把门打开。
7.汽车租赁
大多数城市以及机场和车站都由汽车租赁公司提供服务。出示国际驾驶执照后，你可以租一辆车去日本旅行，但要事先预约。