女职工流产假的工资由用人单位支付。根据法律规定，劳动者在产假期间，用人单位应当依法支付工资。用人单位未向劳动者支付工资的，劳动者可以向仲裁机构申请仲裁，要求用人单位支付工资。
法律依据：《女职工劳动保护特别规定》第七条 女职工生育享受98天产假，其中产前可以休假15天；难产的，增加产假15天；生育多胞胎的，每多生育1个婴儿，增加产假15天。女职工怀孕未满4个月流产的，享受15天产假；怀孕满4个月流产的，享受42天产假。《劳动法》第五十一条劳动者在法定休假日和婚丧假期间以及依法参加社会活动期间，用人单位应当依法支付工资。