刑事案件证据不足事实不清一般情况下会不予起诉。刑事案件在证据不足的公安机关会予以撤案；如果移交审查起诉后检察院认为证据不足，并且在补充侦查结束后还是不能满足定罪证据的要求的，检察院会作出不起诉的决定；起诉之后，如果存在证据不足的情形，法院会作出无罪判决。
【法律分析】
提起公诉的实体条件包括两个，一是犯罪嫌疑人的犯罪事实已经查清，证据确实、充分；二是依法应当追究刑事责任。所谓犯罪事实已经查清是指检察机关对下列事实已经查证属实，确定犯罪嫌疑人实施的行为是犯罪，而不是合法行为或者一般违法行为的事实；确定被告人应当负刑事责任，而不是不负刑事责任或者可以免除刑事责任的事实，例如犯罪嫌疑人的年龄、精神状况等；确定犯罪嫌疑人实施的是某一种或某几种性质的犯罪的事实；确定对犯罪嫌疑人应当或者可以从轻、减轻或者从重处罚的量刑情节的事实。查清上述事实，就符合犯罪嫌疑人的事实已经查清的条件。在当代的社会，刑事类型的案件提起诉讼的时候需要注意一些事项。如果是公诉案件的话，应当是由检察机关审查起诉的，如果证据不足并且事实不清楚，那么会对此决定不予起诉，也可以退回补充侦查。
【法律依据】
《中华人民共和国刑事诉讼法》
第一百七十一条 人民检察院审查案件的时候，必须查明：（一）犯罪事实、情节是否清楚，证据是否确实、充分，犯罪性质和罪名的认定是否正确；（二）有无遗漏罪行和其他应当追究刑事责任的人；（三）是否属于不应追究刑事责任的；（四）有无附带民事诉讼；（五）侦查活动是否合法。
第一百七十五条 人民检察院审查案件，可以要求公安机关提供法庭审判所必需的证据材料；认为可能存在本法第五十六条规定的以非法方法收集证据情形的，可以要求其对证据收集的合法性作出说明。人民检察院审查案件，对于需要补充侦查的，可以退回公安机关补充侦查，也可以自行侦查。对于补充侦查的案件，应当在一个月以内补充侦查完毕。补充侦查以二次为限。补充侦查完毕移送人民检察院后，人民检察院重新计算审查起诉期限。对于二次补充侦查的案件，人民检察院仍然认为证据不足，不符合起诉条件的，应当作出不起诉的决定。
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